140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2237 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2237  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  240  6e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000431925  hitchhiker  0.000763101 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1791  hypothetical protein  72.95 
 
 		 122 aa  184  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.379134  hitchhiker  0.00000106844 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2854  hypothetical protein  68.85 
 
 		 139 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.44368  hitchhiker  0.000000266441 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1308  hypothetical protein  66.12 
 
 		 123 aa  169  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.060954  normal  0.0507678 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2011  hypothetical protein  64.75 
 
 		 122 aa  166  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1506  hypothetical protein  69.42 
 
 		 122 aa  157  6e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0208713  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2409  hypothetical protein  63.64 
 
 		 121 aa  153  7e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000218775  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2304  hypothetical protein  71.07 
 
 		 121 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000252834  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2328  hypothetical protein  68.85 
 
 		 122 aa  143  9e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000332693  normal  0.0106381 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2448  hypothetical protein  68.85 
 
 		 122 aa  143  9e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000286894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2256  hypothetical protein  68.03 
 
 		 122 aa  142  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000852478  normal  0.354843 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2617  hypothetical protein  71.9 
 
 		 122 aa  140  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000233192  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2692  hypothetical protein  71.31 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000125494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2576  hypothetical protein  72.73 
 
 		 122 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000163875  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1767  protein of unknown function DUF454  71.9 
 
 		 122 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000313735  hitchhiker  0.0045444 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2383  hypothetical protein  63.87 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000577354  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00419  conserved inner membrane protein  44.17 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0145391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3142  protein of unknown function DUF454  44.17 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0034209  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0545  hypothetical protein  44.17 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0504  hypothetical protein  44.17 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0827221  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00424  hypothetical protein  44.17 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0180358  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3148  hypothetical protein  44.17 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.102596  normal  0.239123 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0511  hypothetical protein  44.17 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000222622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0558  hypothetical protein  43.33 
 
 		 125 aa  105  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03089  hypothetical protein  49.51 
 
 		 115 aa  103  9e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0948  hypothetical protein  44.17 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.368818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0542  hypothetical protein  44.17 
 
 		 125 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0532  hypothetical protein  44.17 
 
 		 125 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0586  hypothetical protein  44.17 
 
 		 125 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0526  hypothetical protein  44.17 
 
 		 125 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0570  hypothetical protein  42.74 
 
 		 132 aa  97.1  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000137123  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2662  hypothetical protein  58.14 
 
 		 117 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.111296  normal  0.437661 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0526  hypothetical protein  47.06 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.63722  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2886  hypothetical protein  53.75 
 
 		 117 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0750  hypothetical protein  42.98 
 
 		 158 aa  85.1  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1226  hypothetical protein  52.44 
 
 		 117 aa  83.6  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0917  hypothetical protein  40.71 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140199  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1017  hypothetical protein  46.02 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.520138  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3459  protein of unknown function DUF454 transmembrane  44.94 
 
 		 117 aa  81.6  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1847  hypothetical protein  37.61 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.331022  normal  0.61235 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1520  hypothetical protein  44.07 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.757291  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2134  hypothetical protein  35.9 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.352277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3478  protein of unknown function DUF454  36.13 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.545002 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1355  hypothetical protein  40.34 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3917  hypothetical protein  50.6 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0768247  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0221  hypothetical protein  39.81 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2869  hypothetical protein  45.22 
 
 		 117 aa  76.3  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0868079  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3740  hypothetical protein  43.86 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.468258  normal  0.0114181 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4518  hypothetical protein  42.86 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3237  hypothetical protein  47.11 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0868911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1363  protein of unknown function DUF454  36.36 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000761785 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1074  hypothetical protein  48.67 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00236568  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3807  hypothetical protein  44.14 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253442  hitchhiker  0.00000298507 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3232  hypothetical protein  45.24 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.34095  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1810  hypothetical protein  39.32 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4024  hypothetical protein  42.86 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0163458 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0722  hypothetical protein  33.06 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1165  hypothetical protein  39.13 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2579  hypothetical protein  33.61 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0152  hypothetical protein  37.37 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0157  hypothetical protein  37.37 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1924  hypothetical protein  39.13 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1133  hypothetical protein  46.22 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.88473  unclonable  0.0000000168817 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2850  protein of unknown function DUF454  37.86 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000168142  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1393  hypothetical protein  44.72 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2172  hypothetical protein  36.75 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4111  hypothetical protein  32.77 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0267  hypothetical protein  51.56 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1530  hypothetical protein  42.37 
 
 		 164 aa  72  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.324606  normal  0.225714 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2688  hypothetical protein  34.75 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04126  hypothetical protein  33.64 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2610  hypothetical protein  42.86 
 
 		 142 aa  70.1  0.000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.287981 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3103  hypothetical protein  38.6 
 
 		 137 aa  70.1  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.362417  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2936  protein of unknown function DUF454  35.45 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.252831  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3041  hypothetical protein  44.25 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1466  hypothetical protein  40.87 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002883  hypothetical protein  43.04 
 
 		 89 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.2374  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1642  hypothetical protein  40.87 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.96968  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1701  hypothetical protein  36.44 
 
 		 181 aa  67  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0681358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2502  hypothetical protein  33.94 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1083  inner membrane protein  40 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2522  hypothetical protein  33.88 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1501  hypothetical protein  52.24 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1045  hypothetical protein  39.13 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000150316  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3072  hypothetical protein  43.02 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0894433  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1113  hypothetical protein  43.06 
 
 		 82 aa  63.9  0.0000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1925  hypothetical protein  32.8 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.946334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0848  hypothetical protein  39.13 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.225476 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0795  hypothetical protein  31.03 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0981  protein of unknown function DUF454  35.37 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.208554  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1041  hypothetical protein  35.9 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667092  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1004  hypothetical protein  36.61 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1817  hypothetical protein  37.39 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0557  protein of unknown function DUF454  41.56 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0642321  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3890  hypothetical protein  38.53 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.482598  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1103  hypothetical protein  36 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.827298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0524  hypothetical protein  46.67 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.286047  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0014  hypothetical protein  43.06 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0553  protein of unknown function DUF454  46.67 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1003  hypothetical protein  35.04 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>