76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002883 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002883  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  178  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.2374  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03089  hypothetical protein  80.9 
 
 		 115 aa  152  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0570  hypothetical protein  50.56 
 
 		 132 aa  105  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000137123  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0558  hypothetical protein  42.05 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2448  hypothetical protein  44.3 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000286894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2328  hypothetical protein  44.3 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000332693  normal  0.0106381 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2256  hypothetical protein  43.04 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000852478  normal  0.354843 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3142  protein of unknown function DUF454  42.05 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0034209  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00424  hypothetical protein  42.05 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0180358  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0511  hypothetical protein  42.05 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000222622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3148  hypothetical protein  42.05 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.102596  normal  0.239123 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0504  hypothetical protein  42.05 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0827221  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0545  hypothetical protein  42.05 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2011  hypothetical protein  45.57 
 
 		 122 aa  67  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00419  conserved inner membrane protein  42.05 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0145391  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1308  hypothetical protein  37.97 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.060954  normal  0.0507678 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1791  hypothetical protein  39.24 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.379134  hitchhiker  0.00000106844 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1530  hypothetical protein  35.06 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.324606  normal  0.225714 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1017  hypothetical protein  40.51 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.520138  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2383  hypothetical protein  38.16 
 
 		 126 aa  60.1  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000577354  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2237  hypothetical protein  43.04 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000431925  hitchhiker  0.000763101 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2617  hypothetical protein  42.5 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000233192  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1506  hypothetical protein  35.44 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0208713  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2854  hypothetical protein  38.75 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.44368  hitchhiker  0.000000266441 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2576  hypothetical protein  41.25 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000163875  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1767  protein of unknown function DUF454  42.5 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000313735  hitchhiker  0.0045444 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2304  hypothetical protein  35.44 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000252834  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2692  hypothetical protein  41.89 
 
 		 122 aa  57  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000125494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1074  hypothetical protein  44.3 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00236568  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2409  hypothetical protein  40.51 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000218775  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3237  hypothetical protein  44.3 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0868911  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1133  hypothetical protein  43.02 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.88473  unclonable  0.0000000168817 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0948  hypothetical protein  36.36 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.368818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3041  hypothetical protein  43.04 
 
 		 122 aa  52.8  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0542  hypothetical protein  40.51 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0586  hypothetical protein  40.51 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0526  hypothetical protein  40.51 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0532  hypothetical protein  40.51 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0526  hypothetical protein  40.51 
 
 		 107 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.63722  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1083  inner membrane protein  38.96 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3478  protein of unknown function DUF454  36.59 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.545002 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1363  protein of unknown function DUF454  33.33 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000761785 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0936  hypothetical protein  30.12 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1924  hypothetical protein  35.87 
 
 		 147 aa  47.4  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04126  hypothetical protein  34.48 
 
 		 174 aa  47.4  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0292  hypothetical protein  37.88 
 
 		 119 aa  46.2  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.176418 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0157  hypothetical protein  33.33 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0152  hypothetical protein  33.33 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1103  hypothetical protein  44.23 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.827298  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1282  hypothetical protein  44.23 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2214  hypothetical protein  34.12 
 
 		 202 aa  45.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.345545  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3072  hypothetical protein  34.85 
 
 		 122 aa  45.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0894433  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2522  hypothetical protein  27.5 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4856  hypothetical protein  29.17 
 
 		 185 aa  43.9  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.715473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4381  hypothetical protein  34.62 
 
 		 131 aa  43.9  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0221  hypothetical protein  30.95 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2869  hypothetical protein  33.33 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0868079  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0750  hypothetical protein  41.67 
 
 		 158 aa  42.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3807  hypothetical protein  36.21 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253442  hitchhiker  0.00000298507 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3103  hypothetical protein  32.89 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.362417  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1355  hypothetical protein  30.38 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2850  protein of unknown function DUF454  35.29 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000168142  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1393  hypothetical protein  29.33 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0557  protein of unknown function DUF454  36 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0642321  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2172  hypothetical protein  30.77 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0553  protein of unknown function DUF454  36 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0524  hypothetical protein  36 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.286047  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2579  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1041  hypothetical protein  38.64 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667092  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1004  hypothetical protein  38.64 
 
 		 137 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3917  hypothetical protein  36.17 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0768247  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1113  hypothetical protein  41.18 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03399  hypothetical protein  36.17 
 
 		 122 aa  40  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1774  protein of unknown function DUF454  36.54 
 
 		 156 aa  40  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.486547  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1003  hypothetical protein  44.12 
 
 		 137 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4220  hypothetical protein  44.12 
 
 		 135 aa  40  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>