143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0221 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0221  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  302  8.000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0267  hypothetical protein  77.31 
 
 		 122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0917  hypothetical protein  48.78 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140199  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2579  hypothetical protein  49.61 
 
 		 135 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3740  hypothetical protein  45.8 
 
 		 137 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.468258  normal  0.0114181 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1355  hypothetical protein  52.07 
 
 		 139 aa  110  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45850  hypothetical protein  48.67 
 
 		 135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3890  hypothetical protein  49.12 
 
 		 135 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.482598  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1466  hypothetical protein  43.94 
 
 		 131 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1642  hypothetical protein  43.94 
 
 		 133 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.96968  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1810  hypothetical protein  43.65 
 
 		 132 aa  104  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0936  hypothetical protein  51.43 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1393  hypothetical protein  45.38 
 
 		 121 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4111  hypothetical protein  40.62 
 
 		 130 aa  100  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4024  hypothetical protein  51.65 
 
 		 121 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0163458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4518  hypothetical protein  51.65 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3807  hypothetical protein  51.65 
 
 		 121 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253442  hitchhiker  0.00000298507 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1924  hypothetical protein  45.76 
 
 		 147 aa  97.8  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1847  hypothetical protein  42.42 
 
 		 140 aa  96.7  9e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.331022  normal  0.61235 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0750  hypothetical protein  51.72 
 
 		 158 aa  96.7  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1363  protein of unknown function DUF454  38.21 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000761785 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2134  hypothetical protein  40.6 
 
 		 140 aa  92.4  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.352277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2850  protein of unknown function DUF454  40 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000168142  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3459  protein of unknown function DUF454 transmembrane  57.89 
 
 		 117 aa  91.3  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1530  hypothetical protein  47.06 
 
 		 164 aa  90.5  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.324606  normal  0.225714 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0570  hypothetical protein  41.38 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000137123  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2172  hypothetical protein  41.18 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2610  hypothetical protein  51.81 
 
 		 142 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.287981 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2886  hypothetical protein  53.09 
 
 		 117 aa  88.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2662  hypothetical protein  53.95 
 
 		 117 aa  88.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.111296  normal  0.437661 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1454  hypothetical protein  36.44 
 
 		 165 aa  87.8  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0600527 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1226  hypothetical protein  53.09 
 
 		 117 aa  87.8  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0553  protein of unknown function DUF454  40.44 
 
 		 152 aa  86.7  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0524  hypothetical protein  40.44 
 
 		 155 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.286047  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3232  hypothetical protein  48.91 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.34095  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2936  protein of unknown function DUF454  35.59 
 
 		 138 aa  86.7  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.252831  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32820  hypothetical protein  46.34 
 
 		 134 aa  83.6  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1501  hypothetical protein  45.83 
 
 		 129 aa  83.6  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1701  hypothetical protein  36.03 
 
 		 181 aa  83.6  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0681358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0557  protein of unknown function DUF454  42.86 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0642321  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00419  conserved inner membrane protein  41.07 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0145391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3142  protein of unknown function DUF454  41.07 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0034209  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1045  hypothetical protein  32.79 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000150316  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0948  hypothetical protein  45.98 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.368818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00424  hypothetical protein  41.07 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0180358  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3478  protein of unknown function DUF454  37.4 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.545002 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0545  hypothetical protein  41.07 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0504  hypothetical protein  41.07 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0827221  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3148  hypothetical protein  41.07 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.102596  normal  0.239123 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0511  hypothetical protein  41.07 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000222622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1791  hypothetical protein  55.22 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.379134  hitchhiker  0.00000106844 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3917  hypothetical protein  46.88 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0768247  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2011  hypothetical protein  53.73 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0542  hypothetical protein  46.51 
 
 		 125 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0526  hypothetical protein  46.51 
 
 		 125 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1308  hypothetical protein  52.24 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.060954  normal  0.0507678 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0532  hypothetical protein  46.51 
 
 		 125 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0586  hypothetical protein  46.51 
 
 		 125 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0558  hypothetical protein  40.18 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2688  hypothetical protein  41.88 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03089  hypothetical protein  40.91 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2502  hypothetical protein  43.14 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0773  hypothetical protein  36.03 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2409  hypothetical protein  52.24 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000218775  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2725  protein of unknown function DUF454  44.63 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04126  hypothetical protein  46.25 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1925  hypothetical protein  40.59 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.946334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1520  hypothetical protein  44.21 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.757291  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2052  hypothetical protein  36.23 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0987297  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2854  hypothetical protein  49.25 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.44368  hitchhiker  0.000000266441 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1558  protein of unknown function DUF454  39.34 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0152  hypothetical protein  30.33 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0157  hypothetical protein  30.33 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0490  protein of unknown function DUF454  40.74 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000104879  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3072  hypothetical protein  39.25 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0894433  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2522  hypothetical protein  38.33 
 
 		 144 aa  73.6  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1165  hypothetical protein  38.79 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4200  hypothetical protein  36.3 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00544524  normal  0.158508 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0722  hypothetical protein  36.36 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2306  protein of unknown function DUF454  25.37 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000646681  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0526  hypothetical protein  48.65 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.63722  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3311  protein of unknown function DUF454  39.33 
 
 		 155 aa  70.5  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.639511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1113  hypothetical protein  42.31 
 
 		 82 aa  70.1  0.000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4856  hypothetical protein  43.62 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.715473  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2137  hypothetical protein  52.56 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.887096  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1774  protein of unknown function DUF454  32.58 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.486547  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03399  hypothetical protein  35.92 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1072  protein of unknown function DUF454  32.09 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0292  hypothetical protein  36.44 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.176418 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1817  hypothetical protein  40.77 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0042  hypothetical protein  39.32 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.701036 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1021  hypothetical protein  57.14 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0014  hypothetical protein  38.02 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1004  hypothetical protein  35.25 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1041  hypothetical protein  34.81 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667092  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1282  hypothetical protein  38.04 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4220  hypothetical protein  35.56 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1003  hypothetical protein  34.81 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4416  hypothetical protein  40.43 
 
 		 159 aa  63.5  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.799687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1115  hypothetical protein  41.56 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.242011 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>