140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0750 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0750  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  318  3e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3740  hypothetical protein  44.62 
 
 
137 aa  103  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.468258  normal  0.0114181 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1642  hypothetical protein  46.49 
 
 
133 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.96968  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00419  conserved inner membrane protein  42.98 
 
 
125 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0145391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3142  protein of unknown function DUF454  42.98 
 
 
125 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0034209  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00424  hypothetical protein  42.98 
 
 
125 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0180358  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0545  hypothetical protein  42.98 
 
 
125 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0504  hypothetical protein  42.98 
 
 
125 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0827221  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3148  hypothetical protein  42.98 
 
 
125 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.102596  normal  0.239123 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0511  hypothetical protein  42.98 
 
 
125 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000222622  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0558  hypothetical protein  42.98 
 
 
125 aa  97.8  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13567  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4111  hypothetical protein  47.17 
 
 
130 aa  97.4  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0221  hypothetical protein  51.72 
 
 
150 aa  97.1  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2172  hypothetical protein  39.84 
 
 
139 aa  96.7  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1355  hypothetical protein  43.33 
 
 
139 aa  94.7  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0917  hypothetical protein  38.93 
 
 
139 aa  94  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140199  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0570  hypothetical protein  41.88 
 
 
132 aa  94  8e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000137123  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1924  hypothetical protein  47.9 
 
 
147 aa  93.2  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1810  hypothetical protein  46.02 
 
 
132 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1393  hypothetical protein  44.74 
 
 
121 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03089  hypothetical protein  42.73 
 
 
115 aa  92.8  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3807  hypothetical protein  45.05 
 
 
121 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253442  hitchhiker  0.00000298507 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2409  hypothetical protein  43.59 
 
 
121 aa  90.9  6e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000218775  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0542  hypothetical protein  42.61 
 
 
125 aa  90.9  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0586  hypothetical protein  42.61 
 
 
125 aa  90.9  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301005  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0532  hypothetical protein  42.61 
 
 
125 aa  90.9  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0526  hypothetical protein  42.61 
 
 
125 aa  90.9  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45850  hypothetical protein  42.5 
 
 
135 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3890  hypothetical protein  41.67 
 
 
135 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.482598  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2854  hypothetical protein  41.88 
 
 
139 aa  89.7  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.44368  hitchhiker  0.000000266441 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4024  hypothetical protein  45.05 
 
 
121 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0163458 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2011  hypothetical protein  44.74 
 
 
122 aa  89.4  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1466  hypothetical protein  44.25 
 
 
131 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1308  hypothetical protein  44.17 
 
 
123 aa  89  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.060954  normal  0.0507678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4518  hypothetical protein  44.14 
 
 
121 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359562  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0936  hypothetical protein  41.18 
 
 
151 aa  88.2  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0948  hypothetical protein  40 
 
 
125 aa  87.8  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.368818  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1791  hypothetical protein  40.17 
 
 
122 aa  87.8  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.379134  hitchhiker  0.00000106844 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2579  hypothetical protein  39.2 
 
 
135 aa  87.4  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1847  hypothetical protein  31.88 
 
 
140 aa  84.7  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.331022  normal  0.61235 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0267  hypothetical protein  54.29 
 
 
122 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2134  hypothetical protein  29.2 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.352277  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0526  hypothetical protein  44.44 
 
 
107 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.63722  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2662  hypothetical protein  45.45 
 
 
117 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.111296  normal  0.437661 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1165  hypothetical protein  41.11 
 
 
116 aa  77.8  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1530  hypothetical protein  41.03 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.324606  normal  0.225714 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1454  hypothetical protein  48.86 
 
 
165 aa  77.8  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0600527 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2610  hypothetical protein  39.81 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.287981 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3232  hypothetical protein  35.51 
 
 
142 aa  77  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.34095  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2304  hypothetical protein  41.41 
 
 
121 aa  77  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000252834  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1226  hypothetical protein  46.59 
 
 
117 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2886  hypothetical protein  45.45 
 
 
117 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2688  hypothetical protein  42.27 
 
 
123 aa  74.7  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1072  protein of unknown function DUF454  35.09 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1701  hypothetical protein  39.06 
 
 
181 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0681358  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2850  protein of unknown function DUF454  31.09 
 
 
142 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000168142  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2237  hypothetical protein  46.81 
 
 
122 aa  72  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000431925  hitchhiker  0.000763101 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2936  protein of unknown function DUF454  30.08 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.252831  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2617  hypothetical protein  45.57 
 
 
122 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000233192  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4416  hypothetical protein  36.57 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.799687  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3311  protein of unknown function DUF454  38.89 
 
 
155 aa  70.9  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.639511  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0722  hypothetical protein  39.22 
 
 
122 aa  70.5  0.000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1520  hypothetical protein  50 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.757291  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0773  hypothetical protein  41.67 
 
 
138 aa  70.1  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1506  hypothetical protein  40.35 
 
 
122 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0208713  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2692  hypothetical protein  44.3 
 
 
122 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000125494  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0557  protein of unknown function DUF454  43.21 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0642321  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1767  protein of unknown function DUF454  45.57 
 
 
122 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000313735  hitchhiker  0.0045444 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2576  hypothetical protein  45.57 
 
 
122 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000163875  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1558  protein of unknown function DUF454  43.81 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2052  hypothetical protein  44.05 
 
 
178 aa  68.9  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0987297  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1083  inner membrane protein  42.11 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1501  hypothetical protein  41.67 
 
 
129 aa  68.2  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2328  hypothetical protein  42.86 
 
 
122 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000332693  normal  0.0106381 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2448  hypothetical protein  42.86 
 
 
122 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000286894  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2256  hypothetical protein  42.86 
 
 
122 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000852478  normal  0.354843 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1113  hypothetical protein  43.24 
 
 
82 aa  67.4  0.00000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2137  hypothetical protein  43.9 
 
 
116 aa  67.4  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.887096  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0553  protein of unknown function DUF454  46.15 
 
 
152 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1363  protein of unknown function DUF454  28.57 
 
 
139 aa  67  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000761785 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0524  hypothetical protein  46.15 
 
 
155 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.286047  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3478  protein of unknown function DUF454  30.3 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.545002 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2383  hypothetical protein  39.56 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000577354  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2214  hypothetical protein  33.61 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.345545  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1074  hypothetical protein  41.32 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00236568  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1017  hypothetical protein  40.5 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.520138  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2306  protein of unknown function DUF454  32.38 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000646681  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3237  hypothetical protein  41.32 
 
 
133 aa  64.7  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0868911  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1282  hypothetical protein  40.22 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3459  protein of unknown function DUF454 transmembrane  45.21 
 
 
117 aa  64.3  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1103  hypothetical protein  40.22 
 
 
152 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.827298  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3917  hypothetical protein  46.58 
 
 
120 aa  63.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0768247  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0152  hypothetical protein  36.26 
 
 
127 aa  63.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2725  protein of unknown function DUF454  40.8 
 
 
129 aa  63.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0157  hypothetical protein  36.26 
 
 
127 aa  63.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0490  protein of unknown function DUF454  41.56 
 
 
141 aa  63.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000104879  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1925  hypothetical protein  33.88 
 
 
132 aa  62.8  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.946334  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3072  hypothetical protein  42.05 
 
 
122 aa  63.2  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0894433  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1133  hypothetical protein  42.61 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.88473  unclonable  0.0000000168817 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1045  hypothetical protein  33.7 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000150316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>