133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1925 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1925  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  254  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.946334  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2688  hypothetical protein  43.24 
 
 
123 aa  91.3  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1701  hypothetical protein  43.09 
 
 
181 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0681358  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0524  hypothetical protein  53.16 
 
 
155 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.286047  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0553  protein of unknown function DUF454  53.16 
 
 
152 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2886  hypothetical protein  41.03 
 
 
117 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0557  protein of unknown function DUF454  51.9 
 
 
144 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0642321  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3917  hypothetical protein  38.79 
 
 
120 aa  87.4  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0768247  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1226  hypothetical protein  40.17 
 
 
117 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2662  hypothetical protein  40.34 
 
 
117 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.111296  normal  0.437661 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1642  hypothetical protein  37.93 
 
 
133 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.96968  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0586  hypothetical protein  37.7 
 
 
125 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301005  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2502  hypothetical protein  41.88 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0532  hypothetical protein  37.7 
 
 
125 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0526  hypothetical protein  37.7 
 
 
125 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0542  hypothetical protein  37.7 
 
 
125 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3478  protein of unknown function DUF454  36.84 
 
 
140 aa  80.5  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.545002 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2610  hypothetical protein  40.83 
 
 
142 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.287981 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3232  hypothetical protein  42.5 
 
 
142 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.34095  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0948  hypothetical protein  36.07 
 
 
125 aa  79.3  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.368818  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1501  hypothetical protein  41.09 
 
 
129 aa  78.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2172  hypothetical protein  38.14 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00419  conserved inner membrane protein  33.61 
 
 
125 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0145391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3142  protein of unknown function DUF454  33.61 
 
 
125 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0034209  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0545  hypothetical protein  33.61 
 
 
125 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0504  hypothetical protein  33.61 
 
 
125 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0827221  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00424  hypothetical protein  33.61 
 
 
125 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0180358  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3148  hypothetical protein  33.61 
 
 
125 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.102596  normal  0.239123 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0511  hypothetical protein  33.61 
 
 
125 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000222622  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1103  hypothetical protein  38.52 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.827298  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2052  hypothetical protein  41.18 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0987297  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0773  hypothetical protein  41.03 
 
 
138 aa  76.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1282  hypothetical protein  38.46 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3740  hypothetical protein  42.7 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.468258  normal  0.0114181 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1466  hypothetical protein  36.84 
 
 
131 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0221  hypothetical protein  40.59 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0558  hypothetical protein  33.61 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13567  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4518  hypothetical protein  43.82 
 
 
121 aa  74.7  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359562  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1393  hypothetical protein  43.82 
 
 
121 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4024  hypothetical protein  43.82 
 
 
121 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0163458 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1847  hypothetical protein  34.75 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.331022  normal  0.61235 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0267  hypothetical protein  47.06 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2522  hypothetical protein  41.58 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45850  hypothetical protein  33.6 
 
 
135 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3890  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.482598  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2137  hypothetical protein  41.38 
 
 
116 aa  73.9  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.887096  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4220  hypothetical protein  37.5 
 
 
135 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0014  hypothetical protein  42.7 
 
 
117 aa  73.9  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4111  hypothetical protein  36.28 
 
 
130 aa  73.6  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3807  hypothetical protein  42.7 
 
 
121 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253442  hitchhiker  0.00000298507 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4856  hypothetical protein  37.38 
 
 
185 aa  73.2  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.715473  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0917  hypothetical protein  35.83 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140199  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2579  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  72.8  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1041  hypothetical protein  36.36 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667092  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3459  protein of unknown function DUF454 transmembrane  35.9 
 
 
117 aa  72  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0570  hypothetical protein  35.79 
 
 
132 aa  72  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000137123  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1004  hypothetical protein  37.27 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2134  hypothetical protein  33.9 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.352277  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1003  hypothetical protein  36.36 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1810  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0526  hypothetical protein  40.4 
 
 
107 aa  70.1  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.63722  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1308  hypothetical protein  32.79 
 
 
123 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.060954  normal  0.0507678 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3311  protein of unknown function DUF454  39.83 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.639511  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4381  hypothetical protein  33.33 
 
 
131 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2214  hypothetical protein  40.45 
 
 
202 aa  68.2  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.345545  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03399  hypothetical protein  36.63 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3103  hypothetical protein  35.34 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.362417  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1454  hypothetical protein  33.87 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0600527 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1363  protein of unknown function DUF454  31.03 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000761785 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0936  hypothetical protein  35.96 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1520  hypothetical protein  40.79 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.757291  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04126  hypothetical protein  32.08 
 
 
174 aa  64.7  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2850  protein of unknown function DUF454  31.09 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000168142  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3072  hypothetical protein  36.61 
 
 
122 aa  63.5  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0894433  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1578  protein of unknown function DUF454  33.33 
 
 
139 aa  63.5  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1924  hypothetical protein  36.26 
 
 
147 aa  62.8  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1165  hypothetical protein  41.38 
 
 
116 aa  62.8  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2011  hypothetical protein  32.52 
 
 
122 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2296  hypothetical protein  32.48 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.656544  normal  0.0252392 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1017  hypothetical protein  36.36 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.520138  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4416  hypothetical protein  30.58 
 
 
159 aa  62  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.799687  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2869  hypothetical protein  38.33 
 
 
117 aa  61.2  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0868079  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1355  hypothetical protein  35.16 
 
 
139 aa  61.6  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0490  protein of unknown function DUF454  34.91 
 
 
141 aa  61.6  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000104879  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4506  hypothetical protein  32.28 
 
 
132 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1817  hypothetical protein  39.09 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2306  protein of unknown function DUF454  33.78 
 
 
137 aa  60.5  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000646681  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2304  hypothetical protein  36.45 
 
 
121 aa  60.5  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000252834  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2854  hypothetical protein  34.15 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.44368  hitchhiker  0.000000266441 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1115  hypothetical protein  35.92 
 
 
129 aa  58.2  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.242011 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2409  hypothetical protein  33.33 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000218775  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4200  hypothetical protein  42.05 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00544524  normal  0.158508 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03089  hypothetical protein  40.68 
 
 
115 aa  58.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0152  hypothetical protein  23.33 
 
 
127 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0157  hypothetical protein  23.33 
 
 
127 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0750  hypothetical protein  33.06 
 
 
158 aa  57.4  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3577  hypothetical protein  39.17 
 
 
125 aa  57.4  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0042  hypothetical protein  35 
 
 
139 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.701036 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1791  hypothetical protein  37.35 
 
 
122 aa  56.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.379134  hitchhiker  0.00000106844 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6297  protein of unknown function DUF454  35.9 
 
 
124 aa  55.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.932896  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>