More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0636 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0636  aspartate kinase  100 
 
 		 389 aa  796    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03510  aspartate kinase  48.17 
 
 		 395 aa  335  1e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002522  aspartokinase  47.38 
 
 		 395 aa  330  2e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000343675  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0074  aspartate kinase  46.65 
 
 		 395 aa  324  1e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101932  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0969  aspartate kinase  59.54 
 
 		 409 aa  300  3e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3627  aspartate kinase  43.98 
 
 		 413 aa  297  3e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000937685  decreased coverage  0.000000109716 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0626  aspartate kinase  41.77 
 
 		 414 aa  288  1e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000147671  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0567  aspartate kinase  43.55 
 
 		 408 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475671  normal  0.793189 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0927  aspartate kinase  40.93 
 
 		 413 aa  282  7.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34450  aspartate kinase  42.96 
 
 		 411 aa  281  9e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0250796  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1843  aspartate kinase, monofunctional class  42.72 
 
 		 410 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3555  aspartate kinase  54.79 
 
 		 410 aa  279  6e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00961214  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3762  aspartate kinase  42.22 
 
 		 411 aa  279  8e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.216913  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4611  aspartate kinase  42.75 
 
 		 412 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2515  aspartate kinase  42.3 
 
 		 406 aa  277  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00310544  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1639  aspartate kinase  58.33 
 
 		 428 aa  278  2e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000145942  hitchhiker  0.000682871 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52580  aspartate kinase  42.51 
 
 		 412 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1461  aspartate kinase  57.5 
 
 		 428 aa  276  6e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000357046  hitchhiker  0.0000374387 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2902  aspartate kinase  54.2 
 
 		 424 aa  275  8e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1300  aspartate kinase  42.16 
 
 		 408 aa  275  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000018313  normal  0.0162978 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4473  aspartate kinase  53.64 
 
 		 411 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1442  aspartate kinase  53.64 
 
 		 411 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0731797  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3978  aspartate kinase  41.13 
 
 		 411 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3379  aspartate kinase  43.03 
 
 		 410 aa  271  1e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000124538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1290  aspartate kinase  45.01 
 
 		 409 aa  271  2e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.686916  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0571  aspartate kinase  56.92 
 
 		 408 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4274  aspartate kinase  41.91 
 
 		 413 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000967452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0407  aspartate kinase, monofunctional class  56.92 
 
 		 408 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0610  aspartate kinase  42.57 
 
 		 400 aa  269  5e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0685  aspartate kinase  42.82 
 
 		 400 aa  269  5.9999999999999995e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.985937  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1087  aspartate kinase  41.56 
 
 		 400 aa  268  8.999999999999999e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1589  aspartate kinase  42.82 
 
 		 408 aa  268  1e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1612  aspartate kinase  42.69 
 
 		 427 aa  268  1e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000435622  hitchhiker  0.0000000129841 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1377  aspartate kinase  52.71 
 
 		 400 aa  267  2e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000378473  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0669  aspartate kinase  50.9 
 
 		 400 aa  267  2e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0966  aspartate kinase  55.94 
 
 		 412 aa  266  2.9999999999999995e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00725941  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0358  aspartate kinase  56.92 
 
 		 410 aa  265  1e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00114688  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1941  aspartate kinase  42.51 
 
 		 409 aa  264  2e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.122463  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2609  aspartate kinase  41.19 
 
 		 407 aa  262  8e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0578539  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1570  aspartate kinase  53.31 
 
 		 399 aa  259  4e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3427  aspartokinase  59.24 
 
 		 418 aa  258  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2018  aspartate kinase  52.14 
 
 		 399 aa  255  7e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000759653  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2744  aspartate kinase  60.08 
 
 		 418 aa  255  8e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00631887  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1613  aspartate kinase  54.02 
 
 		 414 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  0.584087 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1128  aspartate kinase  59.24 
 
 		 418 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000633865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1199  aspartate kinase  59.24 
 
 		 418 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000597152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2702  aspartate kinase  39.05 
 
 		 426 aa  252  1e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1129  aspartate kinase  58.82 
 
 		 418 aa  251  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000203845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1089  aspartate kinase  39.57 
 
 		 416 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000023583  hitchhiker  0.00464797 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1378  aspartate kinase  38.77 
 
 		 405 aa  249  7e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000455127  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1650  aspartate kinase  38.75 
 
 		 403 aa  249  8e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00485759  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1386  aspartate kinase  50.74 
 
 		 416 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0459009  normal  0.427854 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1515  aspartate kinase, monofunctional class  38.52 
 
 		 405 aa  247  2e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000110315  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1353  aspartate kinase  51.82 
 
 		 422 aa  246  3e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0422902  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1799  aspartate kinase  40.94 
 
 		 405 aa  246  4e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00100247  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08040  aspartate kinase  49.62 
 
 		 427 aa  246  4e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000887302  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1945  aspartate kinase  50.74 
 
 		 416 aa  246  4e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2154  aspartate kinase  51.11 
 
 		 416 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1652  aspartate kinase  51.11 
 
 		 416 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2677  aspartate kinase  51.11 
 
 		 416 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3161  aspartate kinase  51.11 
 
 		 416 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.40885  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2591  aspartate kinase  51.11 
 
 		 416 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1427  aspartate kinase  51.11 
 
 		 416 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2540  aspartate kinase  51.11 
 
 		 416 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.585891  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1106  aspartate kinase  39.33 
 
 		 416 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.736404  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1480  aspartate kinase  41.95 
 
 		 416 aa  245  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.630457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2093  aspartate kinase  50.74 
 
 		 417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1630  aspartate kinase  50.74 
 
 		 416 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000735102  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6003  aspartate kinase  50.74 
 
 		 417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1012  aspartate kinase  39.33 
 
 		 416 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.173113  normal  0.0921493 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2074  aspartate kinase  50.74 
 
 		 417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1425  aspartate kinase  45.82 
 
 		 599 aa  243  3e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1116  aspartate kinase  49.24 
 
 		 404 aa  244  3e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000216352  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1207  aspartate kinase  50.74 
 
 		 416 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.629425  normal  0.263968 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0390  aspartate kinase  53.03 
 
 		 409 aa  243  5e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0999  aspartate kinase  50.78 
 
 		 401 aa  243  5e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.419107  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5380  aspartate kinase  50.74 
 
 		 417 aa  243  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0197228  normal  0.567081 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2506  aspartate kinase  50.37 
 
 		 416 aa  243  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0261079  hitchhiker  0.00613103 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1979  aspartate kinase  50.37 
 
 		 417 aa  242  7e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1049  aspartate kinase  40.15 
 
 		 403 aa  242  7e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00683315  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1126  aspartate kinase  38.61 
 
 		 416 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00000763531  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1167  aspartate kinase  40.44 
 
 		 412 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000835866  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1264  aspartate kinase  40.05 
 
 		 404 aa  241  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000223474  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1044  aspartate kinase  38.65 
 
 		 411 aa  241  2e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1633  aspartate kinase  47.45 
 
 		 405 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000255158  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1171  aspartate kinase  38.85 
 
 		 416 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000593821  normal  0.758494 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1880  aspartate kinase  39.8 
 
 		 405 aa  239  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266682  hitchhiker  0.0000823679 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3123  aspartate kinase  59.24 
 
 		 418 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00206455  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3114  aspartate kinase  59.24 
 
 		 418 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000131076  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3266  aspartate kinase  59.24 
 
 		 418 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00158192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1251  aspartate kinase  59.24 
 
 		 418 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000231974  hitchhiker  0.00000000112827 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3019  aspartate kinase  40.05 
 
 		 405 aa  239  8e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1832  aspartate kinase  43 
 
 		 410 aa  238  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.722812  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2109  aspartate kinase  50.37 
 
 		 417 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371456  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0282  aspartate kinase  48.99 
 
 		 434 aa  238  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0773  aspartate kinase  39.66 
 
 		 406 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0117085  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04060  aspartate kinase  36.41 
 
 		 427 aa  236  6e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.53456 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2318  aspartate kinase  39.8 
 
 		 407 aa  235  9e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000267569  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2531  aspartate kinase  39.3 
 
 		 404 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000021173  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0966  aspartate kinase  40.1 
 
 		 418 aa  235  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0227813  hitchhiker  0.000505058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>