29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05425 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05425  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  237  5e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001483  type III effector HopPmaJ  82.46 
 
 		 114 aa  198  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0843  hypothetical protein  62.28 
 
 		 114 aa  154  5.0000000000000005e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2897  hypothetical protein  60.18 
 
 		 120 aa  145  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0260006 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0589  hypothetical protein  55.26 
 
 		 114 aa  135  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.321476  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3290  hypothetical protein  54.46 
 
 		 122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0842488  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0855  hypothetical protein  51.33 
 
 		 116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0976  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01166  hypothetical protein  53.7 
 
 		 157 aa  125  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1766  HopJ type III effector protein  49.12 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2012  hypothetical protein  50 
 
 		 112 aa  120  8e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000361057  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1402  hypothetical protein  47.12 
 
 		 117 aa  104  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2089  HopJ type III effector protein  50 
 
 		 113 aa  102  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3292  hypothetical protein  44.79 
 
 		 113 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2334  hypothetical protein  43.62 
 
 		 129 aa  88.6  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1914  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10240  hypothetical protein  45.83 
 
 		 113 aa  89  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19600  hypothetical protein  47.92 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1687  type III effector HopPmaJ  47.92 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4495  HopJ type III effector protein  47.22 
 
 		 113 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0806  HopJ type III effector protein  47.37 
 
 		 113 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.269231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31409  predicted protein  45.16 
 
 		 211 aa  88.2  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0888  type III effector HopPmaJ(Pto)  44.55 
 
 		 112 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4619  HopJ type III effector protein  46.3 
 
 		 113 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_27965  predicted protein  39.84 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.658275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1017  type III effector HopJ1  42.73 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1179  HopJ1 protein  43.75 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.965864  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1463  hypothetical protein  41 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100097  hitchhiker  0.0000242165 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1641  hypothetical protein  41 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000672266  hitchhiker  0.00055225 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1614  HopJ type III effector protein  36 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00483863  hitchhiker  0.0000000071157 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>