29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4495 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4495  HopJ type III effector protein  100 
 
 		 113 aa  231  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4619  HopJ type III effector protein  97.35 
 
 		 113 aa  225  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0806  HopJ type III effector protein  91.15 
 
 		 113 aa  212  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.269231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0888  type III effector HopPmaJ(Pto)  88.39 
 
 		 112 aa  207  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1017  type III effector HopJ1  82.3 
 
 		 150 aa  196  7e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1179  HopJ1 protein  81.25 
 
 		 113 aa  191  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.965864  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10240  hypothetical protein  72.32 
 
 		 113 aa  170  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3292  hypothetical protein  69.91 
 
 		 113 aa  167  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1687  type III effector HopPmaJ  67.89 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19600  hypothetical protein  66.97 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0855  hypothetical protein  46.02 
 
 		 116 aa  104  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2897  hypothetical protein  50.52 
 
 		 120 aa  100  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0260006 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3290  hypothetical protein  47 
 
 		 122 aa  94  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0842488  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2089  HopJ type III effector protein  41.28 
 
 		 113 aa  94  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1614  HopJ type III effector protein  47.37 
 
 		 124 aa  89.4  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00483863  hitchhiker  0.0000000071157 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2334  hypothetical protein  40.59 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1914  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1641  hypothetical protein  46.32 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000672266  hitchhiker  0.00055225 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05425  hypothetical protein  47.22 
 
 		 114 aa  88.6  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001483  type III effector HopPmaJ  44.66 
 
 		 114 aa  88.2  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0589  hypothetical protein  43.43 
 
 		 114 aa  87  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.321476  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1402  hypothetical protein  41.96 
 
 		 117 aa  85.5  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1463  hypothetical protein  40.54 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100097  hitchhiker  0.0000242165 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01166  hypothetical protein  44.21 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0843  hypothetical protein  39.29 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2012  hypothetical protein  42.71 
 
 		 112 aa  80.5  0.000000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000361057  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0976  hypothetical protein  40.18 
 
 		 116 aa  80.1  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1766  HopJ type III effector protein  37.5 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_27965  predicted protein  39 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.658275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31409  predicted protein  40.86 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>