29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4619 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4619  HopJ type III effector protein  100 
 
 		 113 aa  231  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4495  HopJ type III effector protein  97.35 
 
 		 113 aa  225  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0806  HopJ type III effector protein  90.27 
 
 		 113 aa  210  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.269231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0888  type III effector HopPmaJ(Pto)  86.61 
 
 		 112 aa  203  7e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1017  type III effector HopJ1  83.19 
 
 		 150 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1179  HopJ1 protein  81.25 
 
 		 113 aa  191  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.965864  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10240  hypothetical protein  73.21 
 
 		 113 aa  173  7e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3292  hypothetical protein  69.03 
 
 		 113 aa  165  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1687  type III effector HopPmaJ  68.81 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19600  hypothetical protein  67.89 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2897  hypothetical protein  51.55 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0260006 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0855  hypothetical protein  45.13 
 
 		 116 aa  101  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3290  hypothetical protein  46.39 
 
 		 122 aa  94  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0842488  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2089  HopJ type III effector protein  41.28 
 
 		 113 aa  93.6  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1614  HopJ type III effector protein  47.37 
 
 		 124 aa  90.9  6e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00483863  hitchhiker  0.0000000071157 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0589  hypothetical protein  44.44 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.321476  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1641  hypothetical protein  46.32 
 
 		 124 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000672266  hitchhiker  0.00055225 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2334  hypothetical protein  39.6 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1914  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001483  type III effector HopPmaJ  43.69 
 
 		 114 aa  88.2  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05425  hypothetical protein  46.3 
 
 		 114 aa  87.4  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1463  hypothetical protein  40.54 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100097  hitchhiker  0.0000242165 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1402  hypothetical protein  41.07 
 
 		 117 aa  82.8  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0843  hypothetical protein  39.29 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01166  hypothetical protein  45.16 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0976  hypothetical protein  41.07 
 
 		 116 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2012  hypothetical protein  42.71 
 
 		 112 aa  80.5  0.000000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000361057  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_27965  predicted protein  40 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.658275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1766  HopJ type III effector protein  37.5 
 
 		 117 aa  76.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31409  predicted protein  39.81 
 
 		 211 aa  70.9  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>