29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0806 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0806  HopJ type III effector protein  100 
 
 		 113 aa  229  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.269231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4495  HopJ type III effector protein  91.15 
 
 		 113 aa  212  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4619  HopJ type III effector protein  90.27 
 
 		 113 aa  210  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0888  type III effector HopPmaJ(Pto)  86.49 
 
 		 112 aa  201  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1017  type III effector HopJ1  80.53 
 
 		 150 aa  192  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1179  HopJ1 protein  77.88 
 
 		 113 aa  185  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.965864  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10240  hypothetical protein  74.31 
 
 		 113 aa  169  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3292  hypothetical protein  69.03 
 
 		 113 aa  165  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1687  type III effector HopPmaJ  68.52 
 
 		 112 aa  147  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19600  hypothetical protein  68.52 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0855  hypothetical protein  46.36 
 
 		 116 aa  103  8e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2897  hypothetical protein  49.48 
 
 		 120 aa  96.3  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0260006 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2089  HopJ type III effector protein  43.4 
 
 		 113 aa  95.9  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3290  hypothetical protein  44.21 
 
 		 122 aa  90.1  9e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0842488  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1641  hypothetical protein  42.2 
 
 		 124 aa  90.1  9e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000672266  hitchhiker  0.00055225 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2334  hypothetical protein  40.59 
 
 		 129 aa  89.4  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1914  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1614  HopJ type III effector protein  43.12 
 
 		 124 aa  88.6  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00483863  hitchhiker  0.0000000071157 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05425  hypothetical protein  47.37 
 
 		 114 aa  88.6  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001483  type III effector HopPmaJ  43.62 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1463  hypothetical protein  40.37 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100097  hitchhiker  0.0000242165 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2012  hypothetical protein  45.74 
 
 		 112 aa  84.3  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000361057  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0589  hypothetical protein  45.16 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.321476  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01166  hypothetical protein  46.24 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1402  hypothetical protein  43.43 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0976  hypothetical protein  44.68 
 
 		 116 aa  80.5  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0843  hypothetical protein  41.94 
 
 		 114 aa  80.1  0.000000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1766  HopJ type III effector protein  37.89 
 
 		 117 aa  76.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_27965  predicted protein  40.21 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.658275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31409  predicted protein  40.79 
 
 		 211 aa  64.3  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>