29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_27965 on replicon NC_009370
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009370  OSTLU_27965  predicted protein  100 
 
 
145 aa  298  2e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.658275  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2897  hypothetical protein  45.76 
 
 
120 aa  104  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0260006 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0855  hypothetical protein  36.43 
 
 
116 aa  94  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2089  HopJ type III effector protein  44.12 
 
 
113 aa  93.2  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3292  hypothetical protein  46 
 
 
113 aa  92  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2012  hypothetical protein  42.74 
 
 
112 aa  91.3  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000361057  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0589  hypothetical protein  40.32 
 
 
114 aa  90.5  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.321476  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001483  type III effector HopPmaJ  43.09 
 
 
114 aa  89.7  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2334  hypothetical protein  38.53 
 
 
129 aa  89.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1914  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3290  hypothetical protein  38.71 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0842488  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1179  HopJ1 protein  42 
 
 
113 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.965864  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05425  hypothetical protein  39.84 
 
 
114 aa  82.8  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1402  hypothetical protein  42 
 
 
117 aa  82.8  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01166  hypothetical protein  43.75 
 
 
157 aa  82.4  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1017  type III effector HopJ1  42 
 
 
150 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1766  HopJ type III effector protein  35.48 
 
 
117 aa  81.6  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796193  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1614  HopJ type III effector protein  35.78 
 
 
124 aa  80.5  0.000000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00483863  hitchhiker  0.0000000071157 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4619  HopJ type III effector protein  40 
 
 
113 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0976  hypothetical protein  38 
 
 
116 aa  77.4  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1641  hypothetical protein  36.27 
 
 
124 aa  77.4  0.00000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000672266  hitchhiker  0.00055225 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4495  HopJ type III effector protein  39 
 
 
113 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19600  hypothetical protein  40.59 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1687  type III effector HopPmaJ  40.59 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0806  HopJ type III effector protein  40.21 
 
 
113 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.269231  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0843  hypothetical protein  39.81 
 
 
114 aa  75.9  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0888  type III effector HopPmaJ(Pto)  39.18 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1463  hypothetical protein  35.35 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100097  hitchhiker  0.0000242165 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10240  hypothetical protein  38.61 
 
 
113 aa  70.1  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31409  predicted protein  32.11 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>