29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3290 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3290  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  252  1.0000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0842488  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2897  hypothetical protein  57.66 
 
 		 120 aa  143  7.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0260006 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0976  hypothetical protein  53.04 
 
 		 116 aa  140  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001483  type III effector HopPmaJ  53.57 
 
 		 114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05425  hypothetical protein  54.46 
 
 		 114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2012  hypothetical protein  53.98 
 
 		 112 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000361057  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0843  hypothetical protein  52.25 
 
 		 114 aa  126  9.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0589  hypothetical protein  46.85 
 
 		 114 aa  117  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.321476  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0855  hypothetical protein  51.89 
 
 		 116 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1766  HopJ type III effector protein  47.66 
 
 		 117 aa  111  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01166  hypothetical protein  41.8 
 
 		 157 aa  110  8.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1402  hypothetical protein  44.23 
 
 		 117 aa  102  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1687  type III effector HopPmaJ  46.43 
 
 		 112 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19600  hypothetical protein  45.54 
 
 		 112 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2089  HopJ type III effector protein  44.95 
 
 		 113 aa  97.4  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4495  HopJ type III effector protein  47 
 
 		 113 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4619  HopJ type III effector protein  46.39 
 
 		 113 aa  94  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3292  hypothetical protein  41.12 
 
 		 113 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0888  type III effector HopPmaJ(Pto)  45.74 
 
 		 112 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31409  predicted protein  43.27 
 
 		 211 aa  91.3  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2334  hypothetical protein  40.59 
 
 		 129 aa  90.5  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1914  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0806  HopJ type III effector protein  44.21 
 
 		 113 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.269231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10240  hypothetical protein  43.27 
 
 		 113 aa  89.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_27965  predicted protein  38.71 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.658275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1614  HopJ type III effector protein  42.72 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00483863  hitchhiker  0.0000000071157 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1463  hypothetical protein  44.66 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100097  hitchhiker  0.0000242165 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1179  HopJ1 protein  42.55 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.965864  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1017  type III effector HopJ1  43.82 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1641  hypothetical protein  44.66 
 
 		 124 aa  84  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000672266  hitchhiker  0.00055225 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>