29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1463 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1463  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  260  4.999999999999999e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100097  hitchhiker  0.0000242165 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1641  hypothetical protein  96.77 
 
 		 124 aa  251  3e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000672266  hitchhiker  0.00055225 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1614  HopJ type III effector protein  76.61 
 
 		 124 aa  202  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00483863  hitchhiker  0.0000000071157 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2089  HopJ type III effector protein  42.59 
 
 		 113 aa  99.4  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0855  hypothetical protein  38.94 
 
 		 116 aa  97.8  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1179  HopJ1 protein  44.44 
 
 		 113 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.965864  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2897  hypothetical protein  38.33 
 
 		 120 aa  92.8  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0260006 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1402  hypothetical protein  45.1 
 
 		 117 aa  90.9  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0888  type III effector HopPmaJ(Pto)  44.14 
 
 		 112 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0589  hypothetical protein  43.88 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.321476  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3292  hypothetical protein  40.78 
 
 		 113 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1017  type III effector HopJ1  42.59 
 
 		 150 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1687  type III effector HopPmaJ  44.21 
 
 		 112 aa  87  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19600  hypothetical protein  44.21 
 
 		 112 aa  85.9  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0806  HopJ type III effector protein  40.37 
 
 		 113 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.269231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2334  hypothetical protein  37.63 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1914  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4619  HopJ type III effector protein  40.54 
 
 		 113 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01166  hypothetical protein  41.84 
 
 		 157 aa  85.5  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3290  hypothetical protein  44.66 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0842488  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4495  HopJ type III effector protein  40.54 
 
 		 113 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2012  hypothetical protein  42.06 
 
 		 112 aa  84.7  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000361057  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0976  hypothetical protein  44.55 
 
 		 116 aa  84.3  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1766  HopJ type III effector protein  40 
 
 		 117 aa  83.6  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10240  hypothetical protein  42.39 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001483  type III effector HopPmaJ  41 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05425  hypothetical protein  41 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0843  hypothetical protein  41 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31409  predicted protein  37.14 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_27965  predicted protein  35.35 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.658275  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>