23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04925 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04925  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  179  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000725  hypothetical protein  83.91 
 
 
87 aa  162  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0012  putative lipoprotein  54.02 
 
 
86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06136  hypothetical protein  63.46 
 
 
51 aa  70.5  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0514  hypothetical protein  56 
 
 
67 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3517  hypothetical protein  56 
 
 
67 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3795  hypothetical protein  54 
 
 
69 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187611  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3977  hypothetical protein  54 
 
 
69 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0473  hypothetical protein  54 
 
 
69 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.366214  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0515  hypothetical protein  60.42 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3851  hypothetical protein  43.4 
 
 
69 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0514  hypothetical protein  54 
 
 
67 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3191  hypothetical protein  49.06 
 
 
58 aa  61.2  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3282  hypothetical protein  50.98 
 
 
56 aa  59.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3345  hypothetical protein  50 
 
 
68 aa  59.7  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0537  hypothetical protein  56.1 
 
 
58 aa  59.3  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0449372  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0552  hypothetical protein  46 
 
 
66 aa  57  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4085  hypothetical protein  42.59 
 
 
67 aa  53.9  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3360  hypothetical protein  62.5 
 
 
60 aa  53.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3590  hypothetical protein  56.76 
 
 
58 aa  53.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1456  hypothetical protein  62.5 
 
 
52 aa  51.2  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2704  hypothetical protein  50 
 
 
239 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2081  hypothetical protein  48.39 
 
 
221 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.442221  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>