21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1456 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1456  hypothetical protein  100 
 
 
52 aa  110  9e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3191  hypothetical protein  50 
 
 
58 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4085  hypothetical protein  49.06 
 
 
67 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0514  hypothetical protein  51.92 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3517  hypothetical protein  51.92 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3851  hypothetical protein  43.64 
 
 
69 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0552  hypothetical protein  48.98 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3360  hypothetical protein  62.16 
 
 
60 aa  62.8  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0515  hypothetical protein  51.92 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3282  hypothetical protein  43.14 
 
 
56 aa  61.6  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3977  hypothetical protein  43.64 
 
 
69 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0473  hypothetical protein  43.64 
 
 
69 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.366214  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0514  hypothetical protein  50 
 
 
67 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06136  hypothetical protein  48.08 
 
 
51 aa  60.8  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3795  hypothetical protein  54.05 
 
 
69 aa  60.1  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187611  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0537  hypothetical protein  52.17 
 
 
58 aa  60.1  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0449372  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3345  hypothetical protein  54.05 
 
 
68 aa  58.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3590  hypothetical protein  58.33 
 
 
58 aa  57.4  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000725  hypothetical protein  36.54 
 
 
87 aa  51.2  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04925  hypothetical protein  62.5 
 
 
87 aa  50.4  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0012  putative lipoprotein  33.33 
 
 
86 aa  45.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>