23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3977 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_0473  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.366214  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3977  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3851  hypothetical protein  98.55 
 
 
69 aa  140  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3795  hypothetical protein  98.55 
 
 
69 aa  140  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187611  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0514  hypothetical protein  81.16 
 
 
67 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0514  hypothetical protein  79.71 
 
 
67 aa  114  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3517  hypothetical protein  79.71 
 
 
67 aa  114  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3345  hypothetical protein  81.16 
 
 
68 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0515  hypothetical protein  73.13 
 
 
67 aa  107  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3191  hypothetical protein  68.42 
 
 
58 aa  89.7  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4085  hypothetical protein  72.73 
 
 
67 aa  88.2  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0537  hypothetical protein  82.98 
 
 
58 aa  87.4  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0449372  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3590  hypothetical protein  71.93 
 
 
58 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0552  hypothetical protein  58.62 
 
 
66 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3282  hypothetical protein  65.45 
 
 
56 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3360  hypothetical protein  84.21 
 
 
60 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06136  hypothetical protein  67.35 
 
 
51 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1456  hypothetical protein  43.64 
 
 
52 aa  61.2  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000725  hypothetical protein  52 
 
 
87 aa  61.2  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0012  putative lipoprotein  48.94 
 
 
86 aa  55.5  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04925  hypothetical protein  54.05 
 
 
87 aa  54.3  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2081  hypothetical protein  45 
 
 
221 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.442221  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2704  hypothetical protein  42.42 
 
 
239 aa  40.4  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>