22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0552 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0552  hypothetical protein  100 
 
 		 66 aa  135  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4085  hypothetical protein  79.31 
 
 		 67 aa  97.4  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0514  hypothetical protein  56.72 
 
 		 67 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3517  hypothetical protein  56.72 
 
 		 67 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3851  hypothetical protein  60.34 
 
 		 69 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0537  hypothetical protein  79.55 
 
 		 58 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0449372  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3282  hypothetical protein  60.34 
 
 		 56 aa  79  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0514  hypothetical protein  54.69 
 
 		 67 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3977  hypothetical protein  58.62 
 
 		 69 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0473  hypothetical protein  58.62 
 
 		 69 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.366214  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0515  hypothetical protein  62.75 
 
 		 67 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3191  hypothetical protein  64 
 
 		 58 aa  77  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3795  hypothetical protein  56.9 
 
 		 69 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3345  hypothetical protein  62.75 
 
 		 68 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3590  hypothetical protein  61.4 
 
 		 58 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3360  hypothetical protein  81.58 
 
 		 60 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1456  hypothetical protein  48.98 
 
 		 52 aa  62.4  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06136  hypothetical protein  56.82 
 
 		 51 aa  58.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04925  hypothetical protein  46 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000725  hypothetical protein  62.5 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0012  putative lipoprotein  44 
 
 		 86 aa  51.6  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2704  hypothetical protein  37.14 
 
 		 239 aa  40.4  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>