21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3590 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3590  hypothetical protein  100 
 
 		 58 aa  118  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3795  hypothetical protein  73.68 
 
 		 69 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3851  hypothetical protein  71.93 
 
 		 69 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0515  hypothetical protein  81.48 
 
 		 67 aa  92.4  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0473  hypothetical protein  71.93 
 
 		 69 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.366214  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3977  hypothetical protein  71.93 
 
 		 69 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0514  hypothetical protein  76.36 
 
 		 67 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3517  hypothetical protein  76.36 
 
 		 67 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0514  hypothetical protein  74.55 
 
 		 67 aa  90.1  8e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3345  hypothetical protein  72.73 
 
 		 68 aa  88.6  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4085  hypothetical protein  65.45 
 
 		 67 aa  84.3  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0537  hypothetical protein  84.09 
 
 		 58 aa  83.6  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0449372  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0552  hypothetical protein  61.4 
 
 		 66 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3191  hypothetical protein  63.79 
 
 		 58 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3282  hypothetical protein  72.92 
 
 		 56 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3360  hypothetical protein  81.58 
 
 		 60 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1456  hypothetical protein  53.19 
 
 		 52 aa  64.7  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06136  hypothetical protein  66.67 
 
 		 51 aa  64.7  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000725  hypothetical protein  50 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0012  putative lipoprotein  48.89 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04925  hypothetical protein  56.76 
 
 		 87 aa  52.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>