22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3517 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0514  hypothetical protein  100 
 
 
67 aa  137  7e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3517  hypothetical protein  100 
 
 
67 aa  137  7e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0514  hypothetical protein  98.51 
 
 
67 aa  135  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0515  hypothetical protein  85.07 
 
 
67 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3345  hypothetical protein  83.82 
 
 
68 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3977  hypothetical protein  79.71 
 
 
69 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0473  hypothetical protein  79.71 
 
 
69 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.366214  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3851  hypothetical protein  78.26 
 
 
69 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3795  hypothetical protein  78.26 
 
 
69 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187611  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4085  hypothetical protein  75 
 
 
67 aa  91.7  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3191  hypothetical protein  75.47 
 
 
58 aa  90.5  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0537  hypothetical protein  85.11 
 
 
58 aa  88.2  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0449372  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3590  hypothetical protein  76.36 
 
 
58 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0552  hypothetical protein  56.72 
 
 
66 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3360  hypothetical protein  86.84 
 
 
60 aa  77  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3282  hypothetical protein  62.07 
 
 
56 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06136  hypothetical protein  69.39 
 
 
51 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1456  hypothetical protein  51.92 
 
 
52 aa  62.4  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000725  hypothetical protein  54 
 
 
87 aa  62.4  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0012  putative lipoprotein  48.94 
 
 
86 aa  55.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04925  hypothetical protein  56.76 
 
 
87 aa  55.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2081  hypothetical protein  45 
 
 
221 aa  41.6  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.442221  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>