22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3282 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3282  hypothetical protein  100 
 
 		 56 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3191  hypothetical protein  70.59 
 
 		 58 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0552  hypothetical protein  60.34 
 
 		 66 aa  79  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3851  hypothetical protein  67.27 
 
 		 69 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3795  hypothetical protein  82.5 
 
 		 69 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0514  hypothetical protein  63.79 
 
 		 67 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0473  hypothetical protein  65.45 
 
 		 69 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.366214  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3977  hypothetical protein  65.45 
 
 		 69 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3517  hypothetical protein  62.07 
 
 		 67 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0514  hypothetical protein  62.07 
 
 		 67 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0515  hypothetical protein  66.67 
 
 		 67 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3345  hypothetical protein  80 
 
 		 68 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0537  hypothetical protein  72.34 
 
 		 58 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0449372  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4085  hypothetical protein  55.93 
 
 		 67 aa  72  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3590  hypothetical protein  81.08 
 
 		 58 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3360  hypothetical protein  78.95 
 
 		 60 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1456  hypothetical protein  43.14 
 
 		 52 aa  61.6  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06136  hypothetical protein  62.22 
 
 		 51 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000725  hypothetical protein  47.06 
 
 		 87 aa  57  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0012  putative lipoprotein  46.67 
 
 		 86 aa  51.6  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04925  hypothetical protein  53.33 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2081  hypothetical protein  50 
 
 		 221 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.442221  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>