22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0537 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0537  hypothetical protein  100 
 
 
58 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0449372  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3795  hypothetical protein  77.19 
 
 
69 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187611  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0473  hypothetical protein  75.44 
 
 
69 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.366214  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3977  hypothetical protein  75.44 
 
 
69 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0514  hypothetical protein  78.18 
 
 
67 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3517  hypothetical protein  78.18 
 
 
67 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3851  hypothetical protein  73.68 
 
 
69 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0514  hypothetical protein  76.36 
 
 
67 aa  94.4  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3345  hypothetical protein  74.55 
 
 
68 aa  92  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0515  hypothetical protein  75.93 
 
 
67 aa  92.4  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3191  hypothetical protein  63.79 
 
 
58 aa  85.1  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4085  hypothetical protein  70.91 
 
 
67 aa  84.3  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3590  hypothetical protein  75.86 
 
 
58 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0552  hypothetical protein  72.92 
 
 
66 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3282  hypothetical protein  75.56 
 
 
56 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3360  hypothetical protein  78.95 
 
 
60 aa  72  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06136  hypothetical protein  61.54 
 
 
51 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1456  hypothetical protein  49.09 
 
 
52 aa  63.9  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000725  hypothetical protein  52.5 
 
 
87 aa  57.4  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04925  hypothetical protein  68.75 
 
 
87 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0012  putative lipoprotein  48.94 
 
 
86 aa  54.7  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2081  hypothetical protein  47.06 
 
 
221 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.442221  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>