23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3345 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3345  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  140  8e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0514  hypothetical protein  85.29 
 
 		 67 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0514  hypothetical protein  83.82 
 
 		 67 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3517  hypothetical protein  83.82 
 
 		 67 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0473  hypothetical protein  81.16 
 
 		 69 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.366214  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3977  hypothetical protein  81.16 
 
 		 69 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3851  hypothetical protein  79.71 
 
 		 69 aa  110  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0515  hypothetical protein  79.41 
 
 		 67 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3795  hypothetical protein  79.71 
 
 		 69 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3191  hypothetical protein  69.81 
 
 		 58 aa  86.3  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0537  hypothetical protein  82.98 
 
 		 58 aa  85.9  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0449372  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4085  hypothetical protein  72.22 
 
 		 67 aa  85.1  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3590  hypothetical protein  72.73 
 
 		 58 aa  79  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0552  hypothetical protein  62.75 
 
 		 66 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3282  hypothetical protein  80 
 
 		 56 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3360  hypothetical protein  81.58 
 
 		 60 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06136  hypothetical protein  63.27 
 
 		 51 aa  67.4  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1456  hypothetical protein  54.05 
 
 		 52 aa  58.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000725  hypothetical protein  42 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0012  putative lipoprotein  48.94 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04925  hypothetical protein  54.05 
 
 		 87 aa  53.5  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2081  hypothetical protein  47.5 
 
 		 221 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.442221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2704  hypothetical protein  45.45 
 
 		 239 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>