21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4085 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4085  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  137  7e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0552  hypothetical protein  79.31 
 
 		 66 aa  97.4  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0514  hypothetical protein  75 
 
 		 67 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3517  hypothetical protein  75 
 
 		 67 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0514  hypothetical protein  73.21 
 
 		 67 aa  90.1  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3851  hypothetical protein  74.55 
 
 		 69 aa  90.1  9e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0515  hypothetical protein  74.07 
 
 		 67 aa  89  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0473  hypothetical protein  72.73 
 
 		 69 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.366214  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3977  hypothetical protein  72.73 
 
 		 69 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3795  hypothetical protein  70.91 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3345  hypothetical protein  72.22 
 
 		 68 aa  85.1  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0537  hypothetical protein  84.09 
 
 		 58 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0449372  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3191  hypothetical protein  70 
 
 		 58 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3590  hypothetical protein  89.19 
 
 		 58 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3360  hypothetical protein  84.21 
 
 		 60 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3282  hypothetical protein  55.93 
 
 		 56 aa  72  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1456  hypothetical protein  49.06 
 
 		 52 aa  63.9  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06136  hypothetical protein  57.14 
 
 		 51 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000725  hypothetical protein  40.74 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04925  hypothetical protein  59.38 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0012  putative lipoprotein  60.61 
 
 		 86 aa  47.8  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>