More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003166 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003166  ribosomal-protein-S5p-alanine acetyltransferase  100 
 
 
194 aa  408  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01920  hypothetical protein  85.57 
 
 
194 aa  358  2e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0927  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  60.96 
 
 
191 aa  249  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0863  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  48.85 
 
 
188 aa  187  7e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2795  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  47.57 
 
 
194 aa  178  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.125941 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2080  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  46.24 
 
 
194 aa  175  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.484761  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1279  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  45.95 
 
 
194 aa  174  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.453788 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1264  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  45.95 
 
 
194 aa  174  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.137217 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2205  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  45.95 
 
 
194 aa  174  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0466951 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1235  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  45.95 
 
 
194 aa  174  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0954445 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2021  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  45.95 
 
 
194 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1803  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  45.7 
 
 
194 aa  173  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01062  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  45.41 
 
 
194 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2580  GCN5-related N-acetyltransferase  45.41 
 
 
194 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.873673  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2063  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  45.41 
 
 
194 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.167866 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2534  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  45.41 
 
 
194 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.680812  normal  0.11611 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1445  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  45.41 
 
 
194 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.197686  hitchhiker  0.00299094 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01070  hypothetical protein  45.41 
 
 
194 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2260  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  45.41 
 
 
194 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1189  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  45.41 
 
 
194 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1189  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  45.41 
 
 
194 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2179  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  44.86 
 
 
194 aa  171  6.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443793  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2275  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  45.41 
 
 
194 aa  168  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1580  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  43.78 
 
 
194 aa  166  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3025  GCN5-related N-acetyltransferase  46.89 
 
 
192 aa  162  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2049  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  42.47 
 
 
194 aa  160  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2161  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  42.47 
 
 
194 aa  160  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.350837  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2442  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  42.47 
 
 
194 aa  160  8.000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.306017  normal  0.727054 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6644  GCN5-related N-acetyltransferase  41.86 
 
 
191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.664947  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39580  ribosomal protein alanine acetyltransferase  42.25 
 
 
189 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0248  GCN5-related N-acetyltransferase  40.59 
 
 
185 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5037  acetyltransferase, including N-acetylases of ribosomal protein  39.41 
 
 
188 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.363067  normal  0.806612 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0944  GCN5-related N-acetyltransferase  37.28 
 
 
179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.839028  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0978  GCN5-related N-acetyltransferase  37.28 
 
 
179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0732  GCN5-related N-acetyltransferase  39.08 
 
 
195 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.820091  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3314  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.31 
 
 
199 aa  132  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0216774 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3339  GCN5-related N-acetyltransferase  41.36 
 
 
197 aa  128  6e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2838  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
295 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00245268 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0088  GCN5-related N-acetyltransferase  38.36 
 
 
205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2685  GCN5-related N-acetyltransferase  36.63 
 
 
184 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1789  GCN5-related N-acetyltransferase  33.52 
 
 
182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0166942  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2448  GCN5-related N-acetyltransferase  34.68 
 
 
183 aa  112  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2278  GCN5-related N-acetyltransferase  34.83 
 
 
189 aa  112  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.172331  normal  0.20084 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3089  GCN5-related N-acetyltransferase  33.72 
 
 
182 aa  111  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.482966  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01610  ribosomal protein alanine acetyltransferase  35.63 
 
 
207 aa  107  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0953  GCN5-related N-acetyltransferase  34.71 
 
 
173 aa  107  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.113437  decreased coverage  0.00454433 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4576  GCN5-related N-acetyltransferase  35.06 
 
 
195 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0597  GCN5-related N-acetyltransferase  33.14 
 
 
206 aa  106  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.310523  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0194  GCN5-related N-acetyltransferase  34.12 
 
 
202 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4797  GCN5-related N-acetyltransferase  32.79 
 
 
195 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1806  GCN5-related N-acetyltransferase  34.12 
 
 
174 aa  105  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3047  GCN5-related N-acetyltransferase  33.93 
 
 
178 aa  104  8e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0386186  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0824  GCN5-related N-acetyltransferase  34.71 
 
 
195 aa  104  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4651  GCN5-related N-acetyltransferase  32.54 
 
 
192 aa  104  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.444768 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0264  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 
194 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1073  ribosomal-protein (S5)-alanine N-acetyltransferase  31.98 
 
 
204 aa  102  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19710  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  32.92 
 
 
195 aa  102  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.204345  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0069  acetyltransferase  33.14 
 
 
312 aa  102  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0066  acetyltransferase  32.56 
 
 
194 aa  100  9e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0482  acetyltransferase  31.95 
 
 
206 aa  99.8  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100807  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0487  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.95 
 
 
206 aa  99.8  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.19146  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0841  putative ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  33.53 
 
 
195 aa  99.8  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0720  GCN5-related N-acetyltransferase  32.94 
 
 
202 aa  99.8  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.235365 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0231  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
194 aa  98.6  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.394828  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4494  GCN5-related N-acetyltransferase  31.07 
 
 
192 aa  98.6  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.697146 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0909  GCN5-related N-acetyltransferase  32.94 
 
 
195 aa  97.8  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0534  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
203 aa  97.1  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  0.612185 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0679  GCN5-related N-acetyltransferase  31.79 
 
 
195 aa  97.1  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231722  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3641  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 
197 aa  97.1  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0758  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 
198 aa  96.7  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.451897  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1253  GCN5-related N-acetyltransferase  31.18 
 
 
202 aa  96.7  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0633  GCN5-related N-acetyltransferase  31.33 
 
 
204 aa  96.7  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4217  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase, putative  32.16 
 
 
180 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000303013  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4279  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.16 
 
 
181 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0297691  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3986  GCN5-related N-acetyltransferase  32.75 
 
 
181 aa  95.9  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0977  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.16 
 
 
181 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278975  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2842  GCN5-related N-acetyltransferase  30.64 
 
 
183 aa  95.1  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4168  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.16 
 
 
181 aa  94  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3892  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.16 
 
 
180 aa  94.4  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.618522  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3899  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.16 
 
 
181 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4053  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.3 
 
 
180 aa  93.2  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4369  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.3 
 
 
180 aa  93.2  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.407529  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4258  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.58 
 
 
181 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.108592  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2552  GCN5-related N-acetyltransferase  35.25 
 
 
148 aa  93.2  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.151632  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0992  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.14 
 
 
181 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4313  GCN5-related N-acetyltransferase  34.01 
 
 
193 aa  92.8  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4320  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.55 
 
 
181 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0690  GCN5-related N-acetyltransferase  30.61 
 
 
204 aa  92.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0170  GCN5-related N-acetyltransferase  33.72 
 
 
212 aa  91.7  7e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6319  GCN5-related N-acetyltransferase  33.13 
 
 
206 aa  90.9  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.640498  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3147  GCN5-related N-acetyltransferase  30.91 
 
 
194 aa  90.5  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.750296 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2226  GCN5-related N-acetyltransferase  29.45 
 
 
192 aa  90.5  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.459408  hitchhiker  0.00554726 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0886  GCN5-related N-acetyltransferase  27.84 
 
 
206 aa  89.4  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3526  GCN5-related N-acetyltransferase  30.06 
 
 
212 aa  88.2  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140052  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0747  GCN5-related N-acetyltransferase  28.11 
 
 
215 aa  88.6  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.215795  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0377  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  29.07 
 
 
221 aa  87.4  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4831  GCN5-related N-acetyltransferase  31.43 
 
 
221 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340541  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8007  GCN5-related N-acetyltransferase  29.94 
 
 
187 aa  86.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0482  GCN5-related N-acetyltransferase  31.69 
 
 
194 aa  86.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.15117  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1899  GCN5-related N-acetyltransferase  30.86 
 
 
217 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.260479 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>