20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0511 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1061  zona occludens toxin  100 
 
 
399 aa  831    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0511  zona occludens toxin  100 
 
 
399 aa  831    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5366  hypothetical protein  39.13 
 
 
424 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101741  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48910  hypothetical protein  39.13 
 
 
427 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000000000000567911  hitchhiker  0.000000114612 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0361  zona occludens toxin  27.24 
 
 
455 aa  112  8.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0881  zona occludens toxin-like protein  27.24 
 
 
455 aa  112  9e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0128926  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2196  zonular occludens toxin  29.18 
 
 
455 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009038  Sbal_4481  hypothetical protein  29.18 
 
 
455 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000142  zona occludens toxin  27.68 
 
 
461 aa  101  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.976786  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02318  hypothetical protein  25.38 
 
 
422 aa  69.7  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05770  hypothetical protein  24.67 
 
 
422 aa  67  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3909  toxin  23.91 
 
 
308 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1090  hypothetical protein  23.55 
 
 
442 aa  51.2  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000680104  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1096  hypothetical protein  23.55 
 
 
442 aa  51.2  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0711878  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3268  hypothetical protein  24.07 
 
 
354 aa  50.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4349  Zonular occludens toxin  26.28 
 
 
443 aa  47.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.126937  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2072  Zonular occludens toxin  20.79 
 
 
348 aa  45.8  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.782716  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1395  Zonular occludens toxin  25 
 
 
351 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00397703  normal  0.781405 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2189  zonular occludens toxin  20.77 
 
 
381 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.766845  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4473  Zonular occludens toxin  26.61 
 
 
448 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.272014  hitchhiker  0.0000467157 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>