18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_3909 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_3909  toxin  100 
 
 
308 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3268  hypothetical protein  72.4 
 
 
354 aa  421  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2097  zonular occludens toxin  37.35 
 
 
341 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0561141 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1395  Zonular occludens toxin  41.84 
 
 
351 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00397703  normal  0.781405 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0719  zonular occludens toxin  41.4 
 
 
400 aa  134  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1399  Zonular occludens toxin  36.87 
 
 
382 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0437506  normal  0.88408 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2548  Zonular occludens toxin  33.94 
 
 
376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00558  hypothetical protein  29.87 
 
 
394 aa  86.3  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.65599  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0985  zonular occludens toxin  32.98 
 
 
384 aa  75.1  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.51619  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0971  zonular occludens toxin  32.98 
 
 
384 aa  75.1  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508291  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2980  putative phage-related membrane protein  27.74 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0110577  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2112  zonular occludens toxin  29.09 
 
 
396 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.37253  normal  0.0869941 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2072  Zonular occludens toxin  24.5 
 
 
348 aa  65.1  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.782716  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0844  Zonular occludens toxin  30.65 
 
 
396 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1061  zona occludens toxin  23.91 
 
 
399 aa  57  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0511  zona occludens toxin  23.91 
 
 
399 aa  57  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4473  Zonular occludens toxin  24.17 
 
 
448 aa  43.5  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.272014  hitchhiker  0.0000467157 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4349  Zonular occludens toxin  27.5 
 
 
443 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.126937  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>