14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4473 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4473  Zonular occludens toxin  100 
 
 		 448 aa  916    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.272014  hitchhiker  0.0000467157 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4349  Zonular occludens toxin  58.72 
 
 		 443 aa  531  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.126937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1090  hypothetical protein  29.87 
 
 		 442 aa  139  8.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000680104  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1096  hypothetical protein  29.87 
 
 		 442 aa  139  8.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0711878  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0988  zonular occludens toxin  26.87 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.2745  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2072  Zonular occludens toxin  23.94 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.782716  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2112  zonular occludens toxin  26.32 
 
 		 396 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.37253  normal  0.0869941 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2395  zonular occludens toxin  23.02 
 
 		 478 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.482518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2402  zonular occludens toxin  22.76 
 
 		 453 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.164441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2189  zonular occludens toxin  28.57 
 
 		 381 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.766845  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3909  toxin  24.17 
 
 		 308 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0511  zona occludens toxin  26.61 
 
 		 399 aa  43.9  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1061  zona occludens toxin  26.61 
 
 		 399 aa  43.9  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2097  zonular occludens toxin  29.75 
 
 		 341 aa  43.1  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561141 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>