14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2072 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2072  Zonular occludens toxin  100 
 
 		 348 aa  719    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.782716  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2980  putative phage-related membrane protein  38.87 
 
 		 274 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0110577  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1090  hypothetical protein  27.47 
 
 		 442 aa  90.1  6e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000680104  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1096  hypothetical protein  27.47 
 
 		 442 aa  90.1  6e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0711878  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3909  toxin  25 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2189  zonular occludens toxin  26.12 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.766845  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4473  Zonular occludens toxin  23.53 
 
 		 448 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.272014  hitchhiker  0.0000467157 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4349  Zonular occludens toxin  23.23 
 
 		 443 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.126937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0988  zonular occludens toxin  24.54 
 
 		 397 aa  56.2  0.0000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.2745  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3268  hypothetical protein  24.14 
 
 		 354 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0511  zona occludens toxin  20.79 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1061  zona occludens toxin  20.79 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2395  zonular occludens toxin  24.41 
 
 		 478 aa  43.5  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.482518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48910  hypothetical protein  23.27 
 
 		 427 aa  42.7  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000000000000567911  hitchhiker  0.000000114612 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>