15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_48910 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_48910  hypothetical protein  100 
 
 
427 aa  874    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000000000000567911  hitchhiker  0.000000114612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5366  hypothetical protein  84.54 
 
 
424 aa  682    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101741  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0511  zona occludens toxin  35.43 
 
 
399 aa  157  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1061  zona occludens toxin  35.43 
 
 
399 aa  157  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0361  zona occludens toxin  27.13 
 
 
455 aa  143  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0881  zona occludens toxin-like protein  27.13 
 
 
455 aa  143  7e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0128926  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000142  zona occludens toxin  27.58 
 
 
461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.976786  n/a   
 
 
-
 
NC_009038  Sbal_4481  hypothetical protein  27.35 
 
 
455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2196  zonular occludens toxin  27.35 
 
 
455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02318  hypothetical protein  25.55 
 
 
422 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05770  hypothetical protein  25.79 
 
 
422 aa  84.7  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2189  zonular occludens toxin  20.53 
 
 
381 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.766845  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2072  Zonular occludens toxin  23.37 
 
 
348 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.782716  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2395  zonular occludens toxin  24.08 
 
 
478 aa  47.4  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.482518  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0719  zonular occludens toxin  22.52 
 
 
400 aa  43.5  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>