13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0881 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0361  zona occludens toxin  99.78 
 
 
455 aa  942    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0881  zona occludens toxin-like protein  100 
 
 
455 aa  943    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0128926  n/a   
 
 
-
 
NC_009038  Sbal_4481  hypothetical protein  34.95 
 
 
455 aa  256  7e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2196  zonular occludens toxin  34.95 
 
 
455 aa  256  7e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000142  zona occludens toxin  33.54 
 
 
461 aa  243  3.9999999999999997e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.976786  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02318  hypothetical protein  31.13 
 
 
422 aa  195  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05770  hypothetical protein  30.73 
 
 
422 aa  191  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48910  hypothetical protein  26.79 
 
 
427 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000000000000567911  hitchhiker  0.000000114612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5366  hypothetical protein  32.47 
 
 
424 aa  130  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101741  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0511  zona occludens toxin  27.24 
 
 
399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1061  zona occludens toxin  27.24 
 
 
399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2402  zonular occludens toxin  21.12 
 
 
453 aa  47  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.164441  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2395  zonular occludens toxin  21.52 
 
 
478 aa  43.9  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.482518  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>