14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1395 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1395  Zonular occludens toxin  100 
 
 		 351 aa  728    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00397703  normal  0.781405 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1399  Zonular occludens toxin  39.88 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0437506  normal  0.88408 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2548  Zonular occludens toxin  41.36 
 
 		 376 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0719  zonular occludens toxin  38.36 
 
 		 400 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2097  zonular occludens toxin  34.08 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561141 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0844  Zonular occludens toxin  34.22 
 
 		 396 aa  156  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3909  toxin  41.84 
 
 		 308 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2112  zonular occludens toxin  32.66 
 
 		 396 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.37253  normal  0.0869941 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3268  hypothetical protein  42.61 
 
 		 354 aa  135  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00558  hypothetical protein  29.82 
 
 		 394 aa  104  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.65599  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0971  zonular occludens toxin  25.27 
 
 		 384 aa  94.7  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508291  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0985  zonular occludens toxin  25.27 
 
 		 384 aa  94.7  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.51619  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0511  zona occludens toxin  25 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1061  zona occludens toxin  25 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>