13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1399 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1399  Zonular occludens toxin  100 
 
 		 382 aa  787    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0437506  normal  0.88408 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2548  Zonular occludens toxin  65.64 
 
 		 376 aa  482  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1395  Zonular occludens toxin  40.37 
 
 		 351 aa  222  9e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00397703  normal  0.781405 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0844  Zonular occludens toxin  32.8 
 
 		 396 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2112  zonular occludens toxin  32.6 
 
 		 396 aa  168  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.37253  normal  0.0869941 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0719  zonular occludens toxin  32.91 
 
 		 400 aa  167  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2097  zonular occludens toxin  31.45 
 
 		 341 aa  155  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561141 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00558  hypothetical protein  29.94 
 
 		 394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.65599  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3909  toxin  35.68 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3268  hypothetical protein  36.31 
 
 		 354 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0971  zonular occludens toxin  25.79 
 
 		 384 aa  108  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508291  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0985  zonular occludens toxin  25.79 
 
 		 384 aa  108  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.51619  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2140  Zonular occludens toxin  26.95 
 
 		 276 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0914527  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>