More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1999 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1999  8-amino-7-oxononanoate synthase  100 
 
 
383 aa  720    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3628  8-amino-7-oxononanoate synthase  68.7 
 
 
380 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.398519  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2789  8-amino-7-oxononanoate synthase  68.42 
 
 
380 aa  437  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3094  8-amino-7-oxononanoate synthase  66.2 
 
 
382 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.607978  normal  0.0492982 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3077  8-amino-7-oxononanoate synthase  66.2 
 
 
382 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3137  8-amino-7-oxononanoate synthase  66.2 
 
 
382 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.820035 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2974  8-amino-7-oxononanoate synthase  65.94 
 
 
402 aa  404  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11601  8-amino-7-oxononanoate synthase  66.03 
 
 
386 aa  379  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0438843  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3696  8-amino-7-oxononanoate synthase  62.36 
 
 
386 aa  369  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.18258  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7713  8-amino-7-oxononanoate synthase  60.94 
 
 
404 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0969  8-amino-7-oxononanoate synthase  56.33 
 
 
418 aa  354  1e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211572  normal  0.251268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8308  8-amino-7-oxononanoate synthase  58.47 
 
 
389 aa  354  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3761  8-amino-7-oxononanoate synthase  60.43 
 
 
397 aa  353  2e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.710177  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10110  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.07 
 
 
395 aa  339  5e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5864  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.82 
 
 
392 aa  337  1.9999999999999998e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3413  8-amino-7-oxononanoate synthase  53.85 
 
 
380 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1570  8-amino-7-oxononanoate synthase  50.4 
 
 
378 aa  265  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.51631 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0611  8-amino-7-oxononanoate synthase  53.48 
 
 
407 aa  259  7e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.542357  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0471  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.86 
 
 
370 aa  253  5.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00372149 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1053  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.13 
 
 
403 aa  248  1e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.147295 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1665  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.76 
 
 
390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000158621  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2967  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.19 
 
 
396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.61 
 
 
391 aa  232  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0424  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.85 
 
 
381 aa  231  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.369907  normal  0.0974656 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3246  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.35 
 
 
391 aa  230  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1326  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.42 
 
 
384 aa  230  4e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6894  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.65 
 
 
399 aa  229  8e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2856  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.19 
 
 
390 aa  224  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.07 
 
 
390 aa  224  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0065  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.43 
 
 
381 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00162329  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0067  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.43 
 
 
381 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1519  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.07 
 
 
378 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.693969  decreased coverage  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3919  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.29 
 
 
404 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0458222 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  36.1 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0699  aminotransferase class I and II  36.34 
 
 
396 aa  220  3e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2100  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.78 
 
 
386 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4834  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.83 
 
 
380 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348424 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0842  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.56 
 
 
396 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.99 
 
 
384 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  33.51 
 
 
395 aa  216  4e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.47 
 
 
397 aa  216  5e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.01 
 
 
389 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2897  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.35 
 
 
387 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786658  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1570  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.04 
 
 
501 aa  216  5.9999999999999996e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.537635  normal  0.306191 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.52 
 
 
393 aa  216  7e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0530  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.21 
 
 
396 aa  216  7e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.730891 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0448  aminotransferase class I and II  37.32 
 
 
428 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.341482  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.54 
 
 
388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0039  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.84 
 
 
395 aa  213  5.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1979  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.77 
 
 
397 aa  212  1e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2194  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  33.77 
 
 
395 aa  211  2e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2557  Glycine C-acetyltransferase  36.36 
 
 
403 aa  211  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.470257  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0423  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.59 
 
 
384 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2755  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.61 
 
 
394 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.31 
 
 
389 aa  210  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1346  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.27 
 
 
392 aa  210  4e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.404227  normal  0.0485323 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1096  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.14 
 
 
370 aa  209  5e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.177322  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0601  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.09 
 
 
401 aa  209  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  34.87 
 
 
395 aa  209  8e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  33.53 
 
 
391 aa  209  9e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0886  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.09 
 
 
370 aa  208  1e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06510  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.09 
 
 
401 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2068  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.53 
 
 
387 aa  207  3e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0002  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.4 
 
 
370 aa  207  3e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0999  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  35.26 
 
 
380 aa  205  8e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0816  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.02 
 
 
383 aa  204  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.497874  normal  0.203864 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0317  8-amino-7-oxononanoate synthase  30.79 
 
 
385 aa  204  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2195  Glycine C-acetyltransferase  33.82 
 
 
401 aa  204  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880865  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0857  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.76 
 
 
383 aa  204  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.106741  normal  0.0484111 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18681  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  35.26 
 
 
380 aa  204  3e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2819  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.07 
 
 
386 aa  203  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.238306 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2875  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.69 
 
 
383 aa  203  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3111  serine palmitoyltransferase  33.53 
 
 
399 aa  203  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0352  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.2 
 
 
393 aa  203  4e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1126  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.36 
 
 
387 aa  203  5e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05990  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.35 
 
 
391 aa  203  5e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1185  glycine C-acetyltransferase  35.21 
 
 
396 aa  202  6e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1662  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.23 
 
 
391 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1130  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.87 
 
 
396 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0133  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.73 
 
 
392 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0106  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.31 
 
 
392 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.209917  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0049  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  35.66 
 
 
396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0057  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  35.57 
 
 
396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2473  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.68 
 
 
389 aa  200  3e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00670549  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1419  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.64 
 
 
381 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0048  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  36.02 
 
 
396 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000159697 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0446  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.08 
 
 
394 aa  199  9e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3456  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.16 
 
 
403 aa  199  9e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0094566  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0393  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.76 
 
 
390 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221946  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6357  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.26 
 
 
379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4264  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.37 
 
 
394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2435  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.5 
 
 
391 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_002950  PG1780  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.53 
 
 
395 aa  197  3e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5431  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.15 
 
 
407 aa  197  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4686  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.88 
 
 
396 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0950  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.23 
 
 
367 aa  197  3e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2132  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.07 
 
 
350 aa  197  3e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0147  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  34.67 
 
 
395 aa  197  3e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4087  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.43 
 
 
389 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.996565  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3561  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.4 
 
 
397 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0270592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>