More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_10110 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_10110  8-amino-7-oxononanoate synthase  100 
 
 
395 aa  772    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5864  8-amino-7-oxononanoate synthase  72.58 
 
 
392 aa  472  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3628  8-amino-7-oxononanoate synthase  60.16 
 
 
380 aa  381  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.398519  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2789  8-amino-7-oxononanoate synthase  58.29 
 
 
380 aa  376  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8308  8-amino-7-oxononanoate synthase  58.99 
 
 
389 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3077  8-amino-7-oxononanoate synthase  58.27 
 
 
382 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3137  8-amino-7-oxononanoate synthase  58.27 
 
 
382 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.820035 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3094  8-amino-7-oxononanoate synthase  58.27 
 
 
382 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.607978  normal  0.0492982 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3696  8-amino-7-oxononanoate synthase  58.58 
 
 
386 aa  360  2e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.18258  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7713  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.07 
 
 
404 aa  357  2.9999999999999997e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0969  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.4 
 
 
418 aa  350  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211572  normal  0.251268 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11601  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.41 
 
 
386 aa  338  7e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0438843  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3761  8-amino-7-oxononanoate synthase  59.58 
 
 
397 aa  333  4e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.710177  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2974  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.55 
 
 
402 aa  326  4.0000000000000003e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0611  8-amino-7-oxononanoate synthase  58.55 
 
 
407 aa  325  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.542357  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1999  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.57 
 
 
383 aa  323  5e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3413  8-amino-7-oxononanoate synthase  54.95 
 
 
380 aa  311  9e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1570  8-amino-7-oxononanoate synthase  53.99 
 
 
378 aa  310  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.51631 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1053  8-amino-7-oxononanoate synthase  54.15 
 
 
403 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.147295 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1519  8-amino-7-oxononanoate synthase  54.26 
 
 
378 aa  290  4e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.693969  decreased coverage  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0471  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.02 
 
 
370 aa  273  6e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00372149 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2967  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.6 
 
 
396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0065  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.95 
 
 
381 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00162329  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0067  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.39 
 
 
381 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.7 
 
 
390 aa  242  7e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.98 
 
 
384 aa  242  7.999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  36.94 
 
 
395 aa  241  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2856  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.74 
 
 
390 aa  239  9e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.18 
 
 
391 aa  237  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.92 
 
 
388 aa  236  4e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0699  aminotransferase class I and II  39.23 
 
 
396 aa  236  6e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0424  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.86 
 
 
381 aa  234  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.369907  normal  0.0974656 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  38.3 
 
 
395 aa  233  5e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3246  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.45 
 
 
391 aa  231  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  36.15 
 
 
395 aa  230  4e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0842  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.68 
 
 
396 aa  229  5e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4251  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.31 
 
 
394 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  36.69 
 
 
391 aa  227  2e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2344  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.35 
 
 
403 aa  227  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2397  Glycine C-acetyltransferase  37.33 
 
 
401 aa  226  6e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135893  normal  0.0678456 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.05 
 
 
389 aa  224  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.06 
 
 
393 aa  224  3e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3873  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.48 
 
 
395 aa  223  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2775  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.37 
 
 
396 aa  223  4e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00358245  normal  0.0206135 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3859  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.48 
 
 
395 aa  223  6e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4026  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.48 
 
 
395 aa  222  8e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4339  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.48 
 
 
395 aa  222  8e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4141  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.48 
 
 
395 aa  222  8e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0999  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  35.65 
 
 
380 aa  222  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0147  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  38.19 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.85 
 
 
389 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4187  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.89 
 
 
395 aa  219  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0106  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.36 
 
 
392 aa  219  5e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.209917  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4834  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.47 
 
 
380 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348424 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0448  aminotransferase class I and II  37.2 
 
 
428 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.341482  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2755  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.68 
 
 
394 aa  219  7.999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1665  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.94 
 
 
390 aa  218  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000158621  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.43 
 
 
397 aa  218  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1009  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.53 
 
 
395 aa  218  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2897  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.56 
 
 
387 aa  218  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786658  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4228  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.53 
 
 
395 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.323305  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1570  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.64 
 
 
501 aa  217  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.537635  normal  0.306191 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2473  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.66 
 
 
389 aa  216  4e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00670549  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18681  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  35.07 
 
 
380 aa  216  4e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2816  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.56 
 
 
395 aa  216  5e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2819  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.3 
 
 
386 aa  216  5e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.238306 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3949  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.42 
 
 
395 aa  216  5e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2194  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  35.48 
 
 
395 aa  216  7e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1166  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.69 
 
 
386 aa  215  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.609374  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0352  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.65 
 
 
393 aa  215  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1326  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.62 
 
 
384 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2430  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.9 
 
 
406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0142166 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1549  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  32.97 
 
 
393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000387483  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1652  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  37.46 
 
 
393 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3561  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.26 
 
 
397 aa  213  7e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0270592 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0423  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.88 
 
 
384 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2207  Glycine C-acetyltransferase  34.01 
 
 
416 aa  212  9e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.35112  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1096  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.42 
 
 
370 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.177322  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15881  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  35.69 
 
 
376 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.516348  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2093  8-amino-7-oxononanoate synthase  40 
 
 
391 aa  211  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0530  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.39 
 
 
396 aa  211  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.730891 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2358  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.48 
 
 
406 aa  210  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000259598 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0718  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.22 
 
 
382 aa  209  5e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2739  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.9 
 
 
401 aa  209  6e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2435  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.04 
 
 
391 aa  209  6e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0710  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.12 
 
 
401 aa  209  7e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1561  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  33.61 
 
 
379 aa  209  7e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.158607  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3534  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.58 
 
 
398 aa  209  7e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1051  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.73 
 
 
398 aa  209  9e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.307967  normal  0.238477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2195  Glycine C-acetyltransferase  34.02 
 
 
401 aa  208  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880865  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2518  aminotransferase, class I and II  38.76 
 
 
406 aa  208  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000907051 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1685  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.21 
 
 
405 aa  207  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.888348  normal  0.418034 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6894  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.71 
 
 
399 aa  207  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3919  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.87 
 
 
404 aa  207  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0458222 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0628  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.8 
 
 
401 aa  207  4e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0133  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.2 
 
 
392 aa  206  7e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06510  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.71 
 
 
401 aa  206  7e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1476  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.41 
 
 
399 aa  205  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0484  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.87 
 
 
399 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2557  Glycine C-acetyltransferase  34.91 
 
 
403 aa  205  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.470257  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>