More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3761 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3761  8-amino-7-oxononanoate synthase  100 
 
 		 397 aa  748    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.710177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0969  8-amino-7-oxononanoate synthase  69.72 
 
 		 418 aa  475  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211572  normal  0.251268 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3628  8-amino-7-oxononanoate synthase  64.78 
 
 		 380 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.398519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3094  8-amino-7-oxononanoate synthase  64.34 
 
 		 382 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.607978  normal  0.0492982 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3077  8-amino-7-oxononanoate synthase  64.08 
 
 		 382 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3137  8-amino-7-oxononanoate synthase  64.08 
 
 		 382 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.820035 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8308  8-amino-7-oxononanoate synthase  60.21 
 
 		 389 aa  388  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7713  8-amino-7-oxononanoate synthase  61.44 
 
 		 404 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2789  8-amino-7-oxononanoate synthase  62.37 
 
 		 380 aa  389  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3696  8-amino-7-oxononanoate synthase  60.32 
 
 		 386 aa  381  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.18258  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11601  8-amino-7-oxononanoate synthase  60.21 
 
 		 386 aa  369  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0438843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2974  8-amino-7-oxononanoate synthase  58.87 
 
 		 402 aa  355  6.999999999999999e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1999  8-amino-7-oxononanoate synthase  60.93 
 
 		 383 aa  340  2e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5864  8-amino-7-oxononanoate synthase  58.74 
 
 		 392 aa  332  7.000000000000001e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10110  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.65 
 
 		 395 aa  315  8e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3413  8-amino-7-oxononanoate synthase  54.13 
 
 		 380 aa  308  9e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1570  8-amino-7-oxononanoate synthase  56.49 
 
 		 378 aa  297  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.51631 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1053  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.54 
 
 		 403 aa  290  4e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.147295 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0611  8-amino-7-oxononanoate synthase  56.51 
 
 		 407 aa  272  7e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.542357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0471  8-amino-7-oxononanoate synthase  53.48 
 
 		 370 aa  264  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00372149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1519  8-amino-7-oxononanoate synthase  54.62 
 
 		 378 aa  259  7e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.693969  decreased coverage  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2967  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.24 
 
 		 396 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3561  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.84 
 
 		 397 aa  236  6e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0270592 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0106  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.95 
 
 		 392 aa  236  7e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.209917  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0424  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.14 
 
 		 381 aa  235  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.369907  normal  0.0974656 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0423  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.35 
 
 		 384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.33 
 
 		 390 aa  229  6e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.05 
 
 		 391 aa  227  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1665  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.81 
 
 		 390 aa  228  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000158621  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6894  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.49 
 
 		 399 aa  227  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2755  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.58 
 
 		 394 aa  224  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1326  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.22 
 
 		 384 aa  224  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.87 
 
 		 384 aa  224  2e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2856  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.94 
 
 		 390 aa  221  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  36.18 
 
 		 395 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  34.46 
 
 		 395 aa  219  5e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1570  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.17 
 
 		 501 aa  217  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.537635  normal  0.306191 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.3 
 
 		 389 aa  218  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0065  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.7 
 
 		 381 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00162329  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2473  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.66 
 
 		 389 aa  216  5e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00670549  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0842  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.76 
 
 		 396 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.42 
 
 		 388 aa  215  8e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3246  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.99 
 
 		 391 aa  215  9e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0067  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.62 
 
 		 381 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1130  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.06 
 
 		 396 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0317  8-amino-7-oxononanoate synthase  30.59 
 
 		 385 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0446  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.06 
 
 		 394 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4264  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.57 
 
 		 394 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4834  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.7 
 
 		 380 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348424 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0886  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.07 
 
 		 370 aa  212  9e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1470  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.54 
 
 		 402 aa  212  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.000728084  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.08 
 
 		 389 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0172  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.57 
 
 		 394 aa  210  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0002  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.27 
 
 		 370 aa  209  7e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1096  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.69 
 
 		 370 aa  209  8e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.177322  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2194  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  35.12 
 
 		 395 aa  209  9e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3534  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.5 
 
 		 398 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3873  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.35 
 
 		 395 aa  208  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0039  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.11 
 
 		 395 aa  207  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  31.28 
 
 		 393 aa  207  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1476  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.91 
 
 		 399 aa  207  4e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4251  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.98 
 
 		 394 aa  206  5e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2897  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.08 
 
 		 387 aa  206  5e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786658  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3602  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.5 
 
 		 398 aa  206  7e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6357  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.51 
 
 		 379 aa  206  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2838  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.36 
 
 		 389 aa  206  8e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3452  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.65 
 
 		 397 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427892  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1346  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.81 
 
 		 392 aa  204  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.404227  normal  0.0485323 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4187  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.87 
 
 		 395 aa  204  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3919  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.18 
 
 		 404 aa  203  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0458222 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0859  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.6 
 
 		 383 aa  204  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2344  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.59 
 
 		 403 aa  203  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0484  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.89 
 
 		 399 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2457  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.62 
 
 		 399 aa  202  8e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0057  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  40.51 
 
 		 396 aa  202  9e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2132  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.44 
 
 		 350 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2100  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.89 
 
 		 386 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15881  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  36.29 
 
 		 376 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.516348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2189  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.86 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3456  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.13 
 
 		 403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0094566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0530  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.35 
 
 		 396 aa  200  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.730891 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0495  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.08 
 
 		 396 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4026  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.17 
 
 		 395 aa  200  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4339  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.17 
 
 		 395 aa  200  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4141  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.17 
 
 		 395 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2441  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.27 
 
 		 382 aa  200  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0723004  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3320  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.75 
 
 		 376 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0699  aminotransferase class I and II  36.42 
 
 		 396 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1662  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.14 
 
 		 391 aa  199  6e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0049  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  35.61 
 
 		 396 aa  199  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2767  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.48 
 
 		 399 aa  199  6e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2819  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.66 
 
 		 386 aa  199  7e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.238306 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3859  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.87 
 
 		 395 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  34.09 
 
 		 391 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1419  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.17 
 
 		 381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1372  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.71 
 
 		 415 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.134715  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1652  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  34.73 
 
 		 393 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2777  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.47 
 
 		 388 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.773541  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0821  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.97 
 
 		 370 aa  197  3e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0625385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0710  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.35 
 
 		 401 aa  197  3e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>