32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1663 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1663  50S ribosomal protein L31e  100 
 
 
91 aa  177  4e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0457  50S ribosomal protein L31e  80.22 
 
 
91 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1825  50S ribosomal protein L31e  76.92 
 
 
91 aa  136  7.999999999999999e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.957131 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1609  50S ribosomal protein L31e  75.82 
 
 
92 aa  134  4e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0473  ribosomal protein L31e  56 
 
 
103 aa  78.2  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0114  50S ribosomal protein L31e  41.56 
 
 
88 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1883  50S ribosomal protein L31e  44.16 
 
 
88 aa  67  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.230339 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0027  Ribosomal protein L31e  40 
 
 
87 aa  65.9  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0539  50S ribosomal protein L31e  42.86 
 
 
87 aa  64.7  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.0000101779  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0458  50S ribosomal protein L31e  41.77 
 
 
89 aa  64.3  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.76449  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3019  50S ribosomal protein L31e  45.57 
 
 
87 aa  64.3  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0201  ribosomal protein L31e  48.68 
 
 
86 aa  63.9  0.0000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.802964  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1969  50S ribosomal protein L31e  40.51 
 
 
87 aa  62  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1479  50S ribosomal protein L31e  41.77 
 
 
87 aa  60.5  0.000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000000475778  hitchhiker  0.000475716 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1568  ribosomal protein L31e  36.14 
 
 
87 aa  56.6  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1263  50S ribosomal protein L31e  36 
 
 
187 aa  56.2  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_17087  Ribosomal protein L31, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  41.03 
 
 
116 aa  52.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0106125  hitchhiker  0.0023739 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1233  Ribosomal protein L31e  30.26 
 
 
92 aa  50.4  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.547002  normal  0.689856 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0234  Ribosomal protein L31e  35.85 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06820  PRCDNA87, putative  36.99 
 
 
126 aa  48.9  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00995827  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1819  Ribosomal protein L31e  35.85 
 
 
92 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.802601  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0827  50S ribosomal protein L31e  30.67 
 
 
92 aa  47.8  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00216714  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0999  50S ribosomal protein L31e  29.49 
 
 
92 aa  47  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0126  50S ribosomal protein L31e  41.1 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0973421  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83357  60S large subunit ribosomal protein  36.62 
 
 
113 aa  46.2  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0888  50S ribosomal protein L31e  39.73 
 
 
83 aa  45.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1059  50S ribosomal protein L31e  38.36 
 
 
83 aa  44.3  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1615  50S ribosomal protein L31e  39.73 
 
 
83 aa  43.5  0.0009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1077  50S ribosomal protein L31e  38.36 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27125  predicted protein  39.13 
 
 
115 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.736977  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1627  50S ribosomal protein L31e  42.31 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000110711  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10681  60S ribosomal protein L31e (AFU_orthologue; AFUA_6G13250)  36.99 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>