28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0458 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0458  50S ribosomal protein L31e  100 
 
 
89 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.76449  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0114  50S ribosomal protein L31e  62.5 
 
 
88 aa  124  5e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1969  50S ribosomal protein L31e  62.79 
 
 
87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1479  50S ribosomal protein L31e  62.65 
 
 
87 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000000475778  hitchhiker  0.000475716 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0539  50S ribosomal protein L31e  61.9 
 
 
87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.0000101779  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1883  50S ribosomal protein L31e  55.68 
 
 
88 aa  103  8e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.230339 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1568  ribosomal protein L31e  52.38 
 
 
87 aa  97.8  5e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3019  50S ribosomal protein L31e  53.57 
 
 
87 aa  95.9  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1077  50S ribosomal protein L31e  55.84 
 
 
83 aa  77.8  0.00000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0999  50S ribosomal protein L31e  44.57 
 
 
92 aa  77  0.00000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0027  Ribosomal protein L31e  44.59 
 
 
87 aa  75.5  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0888  50S ribosomal protein L31e  54.55 
 
 
83 aa  73.6  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1615  50S ribosomal protein L31e  54.55 
 
 
83 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1059  50S ribosomal protein L31e  53.25 
 
 
83 aa  72.8  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1233  Ribosomal protein L31e  41.3 
 
 
92 aa  72  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.547002  normal  0.689856 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0827  50S ribosomal protein L31e  41.3 
 
 
92 aa  72  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00216714  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0126  50S ribosomal protein L31e  50.65 
 
 
83 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0973421  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1825  50S ribosomal protein L31e  44.3 
 
 
91 aa  67.4  0.00000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.957131 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1609  50S ribosomal protein L31e  41.56 
 
 
92 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1663  50S ribosomal protein L31e  41.77 
 
 
91 aa  64.3  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0234  Ribosomal protein L31e  39.74 
 
 
92 aa  61.6  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1819  Ribosomal protein L31e  38.46 
 
 
92 aa  61.6  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.802601  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0457  50S ribosomal protein L31e  40.51 
 
 
91 aa  60.8  0.000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1263  50S ribosomal protein L31e  37.84 
 
 
187 aa  54.7  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10681  60S ribosomal protein L31e (AFU_orthologue; AFUA_6G13250)  41.33 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0473  ribosomal protein L31e  35.53 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0201  ribosomal protein L31e  39.24 
 
 
86 aa  46.2  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.802964  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06820  PRCDNA87, putative  35.38 
 
 
126 aa  40.8  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00995827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>