18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_83357 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_83357  60S large subunit ribosomal protein  100 
 
 		 113 aa  229  9e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10681  60S ribosomal protein L31e (AFU_orthologue; AFUA_6G13250)  70 
 
 		 122 aa  161  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06820  PRCDNA87, putative  59.82 
 
 		 126 aa  130  9e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00995827  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27125  predicted protein  58.42 
 
 		 115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.736977  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_17087  Ribosomal protein L31, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  55.56 
 
 		 116 aa  115  9.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0106125  hitchhiker  0.0023739 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1883  50S ribosomal protein L31e  41.67 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230339 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1663  50S ribosomal protein L31e  36.62 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0888  50S ribosomal protein L31e  31.82 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0126  50S ribosomal protein L31e  28.79 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0973421  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0473  ribosomal protein L31e  33.78 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1263  50S ribosomal protein L31e  34.85 
 
 		 187 aa  45.1  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1059  50S ribosomal protein L31e  30.3 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1077  50S ribosomal protein L31e  32.31 
 
 		 83 aa  44.3  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1615  50S ribosomal protein L31e  31.82 
 
 		 83 aa  44.3  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1479  50S ribosomal protein L31e  41.67 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000000475778  hitchhiker  0.000475716 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3019  50S ribosomal protein L31e  39.58 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0539  50S ribosomal protein L31e  37.5 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.0000101779  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1609  50S ribosomal protein L31e  39.34 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>