30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1263 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1263  50S ribosomal protein L31e  100 
 
 		 187 aa  349  1e-95  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_17087  Ribosomal protein L31, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  42.86 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0106125  hitchhiker  0.0023739 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1479  50S ribosomal protein L31e  41.89 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000000475778  hitchhiker  0.000475716 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3019  50S ribosomal protein L31e  35.14 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0539  50S ribosomal protein L31e  41.89 
 
 		 87 aa  60.5  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.0000101779  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0114  50S ribosomal protein L31e  37.84 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1969  50S ribosomal protein L31e  40 
 
 		 87 aa  57.4  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06820  PRCDNA87, putative  40.7 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00995827  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1663  50S ribosomal protein L31e  36 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1883  50S ribosomal protein L31e  37.5 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0458  50S ribosomal protein L31e  37.84 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.76449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0999  50S ribosomal protein L31e  36.99 
 
 		 92 aa  54.3  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1059  50S ribosomal protein L31e  40.79 
 
 		 83 aa  53.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27125  predicted protein  37.14 
 
 		 115 aa  52.8  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.736977  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0126  50S ribosomal protein L31e  36 
 
 		 83 aa  52.8  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0973421  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0888  50S ribosomal protein L31e  39.47 
 
 		 83 aa  52.4  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1568  ribosomal protein L31e  37.66 
 
 		 87 aa  51.6  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1615  50S ribosomal protein L31e  36.84 
 
 		 83 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0457  50S ribosomal protein L31e  35.06 
 
 		 91 aa  48.9  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1077  50S ribosomal protein L31e  38.16 
 
 		 83 aa  48.1  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1825  50S ribosomal protein L31e  35.63 
 
 		 91 aa  48.1  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.957131 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0027  Ribosomal protein L31e  34.25 
 
 		 87 aa  47.8  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1609  50S ribosomal protein L31e  34.12 
 
 		 92 aa  47.4  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0473  ribosomal protein L31e  35.9 
 
 		 103 aa  46.6  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10681  60S ribosomal protein L31e (AFU_orthologue; AFUA_6G13250)  37.88 
 
 		 122 aa  45.4  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83357  60S large subunit ribosomal protein  34.85 
 
 		 113 aa  45.4  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1819  Ribosomal protein L31e  34.72 
 
 		 92 aa  45.1  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.802601  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1233  Ribosomal protein L31e  30.14 
 
 		 92 aa  44.3  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.547002  normal  0.689856 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0234  Ribosomal protein L31e  31.94 
 
 		 92 aa  44.3  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0827  50S ribosomal protein L31e  31.43 
 
 		 92 aa  41.6  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00216714  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>