26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0827 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0827  50S ribosomal protein L31e  100 
 
 		 92 aa  186  1e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00216714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1233  Ribosomal protein L31e  68.48 
 
 		 92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.547002  normal  0.689856 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0999  50S ribosomal protein L31e  65.22 
 
 		 92 aa  117  6e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0234  Ribosomal protein L31e  66.67 
 
 		 92 aa  111  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1819  Ribosomal protein L31e  62.82 
 
 		 92 aa  107  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.802601  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0114  50S ribosomal protein L31e  40.66 
 
 		 88 aa  80.5  0.000000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1883  50S ribosomal protein L31e  44.83 
 
 		 88 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230339 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1479  50S ribosomal protein L31e  46.51 
 
 		 87 aa  74.3  0.0000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000000475778  hitchhiker  0.000475716 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0458  50S ribosomal protein L31e  41.3 
 
 		 89 aa  72  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.76449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0539  50S ribosomal protein L31e  41.38 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.0000101779  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0027  Ribosomal protein L31e  41.33 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1969  50S ribosomal protein L31e  41.38 
 
 		 87 aa  67  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1568  ribosomal protein L31e  35.71 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3019  50S ribosomal protein L31e  39.08 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1615  50S ribosomal protein L31e  41.38 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0888  50S ribosomal protein L31e  41.38 
 
 		 83 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1059  50S ribosomal protein L31e  40.23 
 
 		 83 aa  57  0.00000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1077  50S ribosomal protein L31e  41.38 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0126  50S ribosomal protein L31e  34.72 
 
 		 83 aa  52  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0973421  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0201  ribosomal protein L31e  31.46 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.802964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1663  50S ribosomal protein L31e  30.67 
 
 		 91 aa  47.8  0.00006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1609  50S ribosomal protein L31e  33.87 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1825  50S ribosomal protein L31e  32 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.957131 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0457  50S ribosomal protein L31e  32.5 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1263  50S ribosomal protein L31e  31.43 
 
 		 187 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0473  ribosomal protein L31e  29.73 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>