30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1077 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1077  50S ribosomal protein L31e  100 
 
 
83 aa  165  2e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0888  50S ribosomal protein L31e  95.18 
 
 
83 aa  157  3e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1059  50S ribosomal protein L31e  92.77 
 
 
83 aa  156  7e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1615  50S ribosomal protein L31e  93.98 
 
 
83 aa  156  9e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0126  50S ribosomal protein L31e  77.11 
 
 
83 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0973421  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0539  50S ribosomal protein L31e  59.26 
 
 
87 aa  84  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.0000101779  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1969  50S ribosomal protein L31e  56.79 
 
 
87 aa  80.9  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1479  50S ribosomal protein L31e  52.38 
 
 
87 aa  78.6  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000000475778  hitchhiker  0.000475716 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0458  50S ribosomal protein L31e  55.84 
 
 
89 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.76449  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1883  50S ribosomal protein L31e  54.43 
 
 
88 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.230339 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3019  50S ribosomal protein L31e  50 
 
 
87 aa  74.7  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1568  ribosomal protein L31e  45.95 
 
 
87 aa  68.9  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0114  50S ribosomal protein L31e  44.44 
 
 
88 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0027  Ribosomal protein L31e  40.7 
 
 
87 aa  62.4  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1233  Ribosomal protein L31e  42.53 
 
 
92 aa  60.5  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.547002  normal  0.689856 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0999  50S ribosomal protein L31e  41.67 
 
 
92 aa  59.3  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10681  60S ribosomal protein L31e (AFU_orthologue; AFUA_6G13250)  44.62 
 
 
122 aa  58.2  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0827  50S ribosomal protein L31e  41.38 
 
 
92 aa  56.6  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00216714  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0234  Ribosomal protein L31e  43.06 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1819  Ribosomal protein L31e  43.06 
 
 
92 aa  55.1  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.802601  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27125  predicted protein  36.92 
 
 
115 aa  51.6  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.736977  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_17087  Ribosomal protein L31, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  38.46 
 
 
116 aa  50.8  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0106125  hitchhiker  0.0023739 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0473  ribosomal protein L31e  44.12 
 
 
103 aa  48.9  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1263  50S ribosomal protein L31e  38.16 
 
 
187 aa  48.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1825  50S ribosomal protein L31e  42.42 
 
 
91 aa  45.4  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.957131 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83357  60S large subunit ribosomal protein  32.31 
 
 
113 aa  44.3  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1609  50S ribosomal protein L31e  41.1 
 
 
92 aa  43.9  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1663  50S ribosomal protein L31e  38.36 
 
 
91 aa  43.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0457  50S ribosomal protein L31e  40.24 
 
 
91 aa  42  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06820  PRCDNA87, putative  33.85 
 
 
126 aa  41.6  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00995827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>