17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_27125 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_27125  predicted protein  100 
 
 
115 aa  234  2e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.736977  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10681  60S ribosomal protein L31e (AFU_orthologue; AFUA_6G13250)  62.38 
 
 
122 aa  131  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06820  PRCDNA87, putative  58.82 
 
 
126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00995827  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83357  60S large subunit ribosomal protein  58.42 
 
 
113 aa  129  1.0000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_17087  Ribosomal protein L31, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  57.55 
 
 
116 aa  122  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0106125  hitchhiker  0.0023739 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1263  50S ribosomal protein L31e  37.14 
 
 
187 aa  52.8  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0888  50S ribosomal protein L31e  36.36 
 
 
83 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1059  50S ribosomal protein L31e  34.85 
 
 
83 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1077  50S ribosomal protein L31e  36.92 
 
 
83 aa  51.6  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1615  50S ribosomal protein L31e  36.36 
 
 
83 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0126  50S ribosomal protein L31e  33.33 
 
 
83 aa  50.8  0.000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0973421  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3019  50S ribosomal protein L31e  45.83 
 
 
87 aa  49.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1883  50S ribosomal protein L31e  41.67 
 
 
88 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.230339 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1479  50S ribosomal protein L31e  34.92 
 
 
87 aa  43.9  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000000475778  hitchhiker  0.000475716 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1663  50S ribosomal protein L31e  39.13 
 
 
91 aa  43.5  0.0009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0473  ribosomal protein L31e  40.85 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0539  50S ribosomal protein L31e  37.04 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.0000101779  normal  0.877558 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>