253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2636 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_1402  nitrate/nitrite antiporter  68.86 
 
 
558 aa  745    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2791  nitrate/nitrite antiporter  68.83 
 
 
542 aa  752    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.657908  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4596  nitrate/nitrite antiporter  70.33 
 
 
552 aa  748    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2636  nitrate/nitrite antiporter  100 
 
 
551 aa  1093    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1004  nitrate/nitrite antiporter  68.5 
 
 
551 aa  744    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3137  nitrate/nitrite antiporter  64.06 
 
 
530 aa  674    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411824  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3762  nitrate/nitrite antiporter  70.32 
 
 
555 aa  739    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1710  nitrate/nitrite antiporter  66.91 
 
 
552 aa  706    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.464257  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1953  nitrate/nitrite transporter  59.96 
 
 
534 aa  632  1e-180  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.276417  normal  0.235717 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2635  major facilitator transporter  60.15 
 
 
534 aa  632  1e-180  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.051359 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2707  nitrate/nitrite transporter  59.89 
 
 
535 aa  626  1e-178  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0536755 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03852  Nitrate/nitrite transporter  60.41 
 
 
546 aa  605  9.999999999999999e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0242427  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1916  nitrite extrusion protein 1  35.11 
 
 
463 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0184588  normal  0.196505 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01201  nitrate/nitrite transporter  34.93 
 
 
463 aa  263  6e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2422  nitrite transporter  34.93 
 
 
463 aa  263  6e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0235943  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2400  nitrite transporter  34.93 
 
 
463 aa  263  6e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000237674 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01211  hypothetical protein  34.93 
 
 
463 aa  263  6e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853589  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1333  nitrite extrusion protein 1  34.93 
 
 
463 aa  263  6e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000558307  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1391  nitrite extrusion protein 1  34.93 
 
 
463 aa  263  6e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00798499  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1707  nitrite extrusion protein 1  34.93 
 
 
463 aa  263  6e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135678  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1374  nitrite extrusion protein 1  34.93 
 
 
461 aa  262  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0787741  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1768  nitrite transporter  33.51 
 
 
468 aa  259  9e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1558  nitrite extrusion protein 1  34.04 
 
 
465 aa  253  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.431226  normal  0.0433169 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1901  nitrite extrusion protein 1  34.04 
 
 
465 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0276869  normal  0.947736 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1896  nitrite extrusion protein 1  34.04 
 
 
465 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0112468  normal  0.326955 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1960  nitrite extrusion protein 1  33.87 
 
 
465 aa  252  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0440291  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1375  nitrite extrusion protein 1  33.57 
 
 
465 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0207934  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2225  nitrite transporter  34.62 
 
 
472 aa  249  9e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190366  normal  0.0765968 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2301  nitrite transporter  34.43 
 
 
472 aa  248  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.123404 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2898  nitrite transporter  35.58 
 
 
462 aa  243  7.999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  52.05 
 
 
893 aa  238  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  48.81 
 
 
912 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  48.02 
 
 
895 aa  233  7.000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0604  MFS nitrate/nitrite transporter NarK  50.85 
 
 
459 aa  233  8.000000000000001e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  48.61 
 
 
905 aa  228  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0665  nitrite transporter  51.28 
 
 
460 aa  227  4e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3863  major facilitator transporter  47.74 
 
 
477 aa  225  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13770  nitrite extrusion protein 2  44.96 
 
 
468 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.45404 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0334  nitrate transporter  47.56 
 
 
475 aa  220  5e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000163846 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1233  nitrite extrusion protein 2  44.6 
 
 
468 aa  219  7e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2237  nitrite transporter  43.64 
 
 
472 aa  216  9e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532951  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  47.51 
 
 
917 aa  211  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1775  nitrite transporter  45.71 
 
 
475 aa  210  7e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610965  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2657  nitrite transporter  49.15 
 
 
457 aa  208  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5001  nitrate transporter  40.93 
 
 
461 aa  208  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0909431  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1704  nitrite transporter  47.44 
 
 
475 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0932912  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2174  nitrate transporter  45.83 
 
 
475 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.642939  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6183  cyclic nucleotide-binding protein  47.19 
 
 
469 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0259908 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2073  nitrate transporter  41.64 
 
 
460 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.741347  normal  0.786812 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0208  nitrite transporter  49.15 
 
 
457 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1108  nitrite transporter  47.44 
 
 
486 aa  194  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0660  nitrite transporter  47.01 
 
 
487 aa  191  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.556146 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2679  nitrite extrusion protein  41.61 
 
 
490 aa  189  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2623  nitrite extrusion protein  41.61 
 
 
490 aa  189  9e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2316  nitrite transporter  38.41 
 
 
465 aa  189  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.95434  normal  0.769623 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2755  nitrate/nitrite transporter NarK  41.99 
 
 
461 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0426  nitrite transporter  46.58 
 
 
481 aa  187  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0435  nitrite transporter  46.58 
 
 
481 aa  187  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2240  nitrite extrusion protein  41.26 
 
 
490 aa  187  5e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.452276  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1730  nitrate/nitrite transporter NarK  41.64 
 
 
461 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1855  nitrate/nitrite transporter NarK  41.64 
 
 
461 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1512  nitrite extrusion protein  41.64 
 
 
461 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.85958  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3079  nitrite extrusion protein  41.64 
 
 
461 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2566  nitrite transporter  39.93 
 
 
462 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2260  nitrite transporter  40.83 
 
 
462 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2079  nitrite extrusion protein 2  41.37 
 
 
462 aa  181  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1850  nitrite transporter  39.72 
 
 
463 aa  180  5.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2178  nitrite transporter  41.01 
 
 
462 aa  179  9e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01427  nitrate/nitrite transporter  41.01 
 
 
462 aa  179  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1705  nitrite extrusion protein 2  41.01 
 
 
462 aa  179  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0635768  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01439  hypothetical protein  41.01 
 
 
462 aa  179  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2187  nitrite transporter  41.01 
 
 
462 aa  179  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.74785  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1553  nitrite extrusion protein 2  41.01 
 
 
462 aa  179  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.615088  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1650  nitrite extrusion protein 2  40.65 
 
 
462 aa  177  6e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3590  nitrite transporter  41.7 
 
 
461 aa  176  9e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.494502  normal  0.38481 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4667  nitrite transporter  41.7 
 
 
461 aa  176  9e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.885517  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0973  nitrite/nitrate ABC transporter transmembrane protein  41.28 
 
 
461 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1585  nitrite extrusion protein 2  41.01 
 
 
466 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1693  nitrite extrusion protein 2  41.01 
 
 
466 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.584294 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1754  nitrite extrusion protein 2  40.65 
 
 
466 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.495939  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1691  nitrite extrusion protein 2  40.65 
 
 
462 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1766  nitrite extrusion protein 2  40.65 
 
 
466 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.408584  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1709  NO3-/NO2- ABC transporter  40.23 
 
 
458 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0245  major facilitator superfamily MFS_1  41.08 
 
 
453 aa  173  6.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.205061  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2061  nitrite transporter  43.62 
 
 
463 aa  173  7.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1330  major facilitator superfamily MFS_1  40.7 
 
 
469 aa  173  9e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2802  major facilitator superfamily MFS_1  32.96 
 
 
476 aa  162  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197835 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1268  major facilitator transporter  36.5 
 
 
470 aa  152  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0770735  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0349  major facilitator transporter  39.57 
 
 
502 aa  152  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.11926  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1313  major facilitator superfamily MFS_1  37.6 
 
 
491 aa  151  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000040275 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2166  major facilitator superfamily MFS_1  43.09 
 
 
461 aa  151  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.203269  normal  0.0459407 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2593  major facilitator transporter  40.17 
 
 
455 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.593061  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5685  major facilitator transporter  40.72 
 
 
455 aa  148  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.180535  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4255  nitrite transporter  37.96 
 
 
456 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.823889  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2362  major facilitator superfamily MFS_1  37.08 
 
 
458 aa  146  9e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.165332  normal  0.523677 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3865  nitrite transporter  35.19 
 
 
455 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5927  nitrite extrusion protein  37.82 
 
 
440 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0123959 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3598  nitrite transporter  47.62 
 
 
699 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0417643 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1769  major facilitator superfamily MFS_1  32.97 
 
 
475 aa  140  6e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00234233  hitchhiker  0.00662065 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10271  integral membrane nitrite extrusion protein narU (nitrite facilitator)  36.84 
 
 
463 aa  140  8.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0502374 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>