245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1953 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1953  nitrate/nitrite transporter  100 
 
 		 534 aa  1064    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.276417  normal  0.235717 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2635  major facilitator transporter  97 
 
 		 534 aa  1043    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.051359 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2791  nitrate/nitrite antiporter  58.55 
 
 		 542 aa  638    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.657908  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1004  nitrate/nitrite antiporter  61.6 
 
 		 551 aa  668    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2707  nitrate/nitrite transporter  71.86 
 
 		 535 aa  800    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0536755 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03852  Nitrate/nitrite transporter  75.79 
 
 		 546 aa  805    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0242427  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3137  nitrate/nitrite antiporter  62.38 
 
 		 530 aa  658    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411824  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1710  nitrate/nitrite antiporter  61.04 
 
 		 552 aa  636    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.464257  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1402  nitrate/nitrite antiporter  58.89 
 
 		 558 aa  634  1e-180  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3762  nitrate/nitrite antiporter  59.37 
 
 		 555 aa  634  1e-180  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4596  nitrate/nitrite antiporter  59.11 
 
 		 552 aa  622  1e-177  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2636  nitrate/nitrite antiporter  59.96 
 
 		 551 aa  608  1e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0604  MFS nitrate/nitrite transporter NarK  50 
 
 		 459 aa  230  5e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  47.48 
 
 		 893 aa  229  7e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  48.75 
 
 		 905 aa  229  9e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1233  nitrite extrusion protein 2  50 
 
 		 468 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13770  nitrite extrusion protein 2  50 
 
 		 468 aa  225  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.45404 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  46.28 
 
 		 912 aa  220  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0665  nitrite transporter  47.92 
 
 		 460 aa  218  2e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  46.28 
 
 		 895 aa  218  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0334  nitrate transporter  46.25 
 
 		 475 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000163846 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1775  nitrite transporter  44.17 
 
 		 475 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610965  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2657  nitrite transporter  48.75 
 
 		 457 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3863  major facilitator transporter  44.58 
 
 		 477 aa  214  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2174  nitrate transporter  44.17 
 
 		 475 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.642939  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5001  nitrate transporter  44.21 
 
 		 461 aa  213  9e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0909431  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0208  nitrite transporter  49.58 
 
 		 457 aa  211  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1768  nitrite transporter  44.73 
 
 		 468 aa  211  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1704  nitrite transporter  43.75 
 
 		 475 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0932912  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6183  cyclic nucleotide-binding protein  45.45 
 
 		 469 aa  206  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0259908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2237  nitrite transporter  45.83 
 
 		 472 aa  205  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  48.72 
 
 		 917 aa  201  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2073  nitrate transporter  43.8 
 
 		 460 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.741347  normal  0.786812 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2623  nitrite extrusion protein  44.63 
 
 		 490 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2679  nitrite extrusion protein  44.63 
 
 		 490 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2755  nitrate/nitrite transporter NarK  44.63 
 
 		 461 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2240  nitrite extrusion protein  44.21 
 
 		 490 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.452276  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1730  nitrate/nitrite transporter NarK  44.21 
 
 		 461 aa  196  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3079  nitrite extrusion protein  44.21 
 
 		 461 aa  196  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1512  nitrite extrusion protein  44.21 
 
 		 461 aa  196  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.85958  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1855  nitrate/nitrite transporter NarK  44.63 
 
 		 461 aa  195  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2260  nitrite transporter  45.12 
 
 		 462 aa  193  6e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2316  nitrite transporter  43.57 
 
 		 465 aa  192  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.95434  normal  0.769623 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2301  nitrite transporter  45.61 
 
 		 472 aa  190  5e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.123404 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0426  nitrite transporter  47.19 
 
 		 481 aa  190  5.999999999999999e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2225  nitrite transporter  45.61 
 
 		 472 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190366  normal  0.0765968 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0435  nitrite transporter  47.62 
 
 		 481 aa  190  5.999999999999999e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2898  nitrite transporter  46.22 
 
 		 462 aa  190  5.999999999999999e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01201  nitrate/nitrite transporter  44.3 
 
 		 463 aa  189  7e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2422  nitrite transporter  44.3 
 
 		 463 aa  189  7e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0235943  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1707  nitrite extrusion protein 1  44.3 
 
 		 463 aa  189  7e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1333  nitrite extrusion protein 1  44.3 
 
 		 463 aa  189  7e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000558307  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2400  nitrite transporter  44.3 
 
 		 463 aa  189  7e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237674 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01211  hypothetical protein  44.3 
 
 		 463 aa  189  7e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853589  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1374  nitrite extrusion protein 1  44.3 
 
 		 461 aa  189  7e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0787741  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1391  nitrite extrusion protein 1  44.3 
 
 		 463 aa  189  7e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00798499  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1916  nitrite extrusion protein 1  43.88 
 
 		 463 aa  189  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0184588  normal  0.196505 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1108  nitrite transporter  45.34 
 
 		 486 aa  188  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1901  nitrite extrusion protein 1  43.88 
 
 		 465 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0276869  normal  0.947736 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1960  nitrite extrusion protein 1  43.88 
 
 		 465 aa  187  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0440291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1558  nitrite extrusion protein 1  43.88 
 
 		 465 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.431226  normal  0.0433169 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1896  nitrite extrusion protein 1  43.88 
 
 		 465 aa  187  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0112468  normal  0.326955 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1375  nitrite extrusion protein 1  43.88 
 
 		 465 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0207934  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2566  nitrite transporter  42.62 
 
 		 462 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0660  nitrite transporter  44.16 
 
 		 487 aa  184  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556146 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1850  nitrite transporter  43.04 
 
 		 463 aa  184  5.0000000000000004e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2178  nitrite transporter  44.3 
 
 		 462 aa  182  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1553  nitrite extrusion protein 2  44.3 
 
 		 462 aa  182  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.615088  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1705  nitrite extrusion protein 2  44.3 
 
 		 462 aa  182  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0635768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2187  nitrite transporter  44.3 
 
 		 462 aa  182  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.74785  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01427  nitrate/nitrite transporter  43.88 
 
 		 462 aa  182  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01439  hypothetical protein  43.88 
 
 		 462 aa  182  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2079  nitrite extrusion protein 2  44.3 
 
 		 462 aa  181  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1650  nitrite extrusion protein 2  43.88 
 
 		 462 aa  180  5.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0973  nitrite/nitrate ABC transporter transmembrane protein  44.17 
 
 		 461 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2061  nitrite transporter  43.6 
 
 		 463 aa  175  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3590  nitrite transporter  44.58 
 
 		 461 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.494502  normal  0.38481 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4667  nitrite transporter  44.58 
 
 		 461 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.885517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1585  nitrite extrusion protein 2  44.03 
 
 		 466 aa  174  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1754  nitrite extrusion protein 2  43.62 
 
 		 466 aa  173  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.495939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1766  nitrite extrusion protein 2  43.62 
 
 		 466 aa  173  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.408584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1691  nitrite extrusion protein 2  43.62 
 
 		 462 aa  173  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1693  nitrite extrusion protein 2  43.46 
 
 		 466 aa  173  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.584294 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0245  major facilitator superfamily MFS_1  37.97 
 
 		 453 aa  169  8e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.205061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1268  major facilitator transporter  45.76 
 
 		 470 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0770735  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1330  major facilitator superfamily MFS_1  36.6 
 
 		 469 aa  164  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2802  major facilitator superfamily MFS_1  49.71 
 
 		 476 aa  163  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197835 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1313  major facilitator superfamily MFS_1  45.2 
 
 		 491 aa  163  7e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000040275 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1709  NO3-/NO2- ABC transporter  38.89 
 
 		 458 aa  162  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0349  major facilitator transporter  45.66 
 
 		 502 aa  160  7e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.11926  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5685  major facilitator transporter  39.09 
 
 		 455 aa  160  8e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.180535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0837  major facilitator superfamily MFS_1  43.82 
 
 		 450 aa  157  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.738269  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2593  major facilitator transporter  36.8 
 
 		 455 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.593061  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2166  major facilitator superfamily MFS_1  44.2 
 
 		 461 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.203269  normal  0.0459407 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2362  major facilitator superfamily MFS_1  35.37 
 
 		 458 aa  152  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.165332  normal  0.523677 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3598  nitrite transporter  44.17 
 
 		 699 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0417643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5927  nitrite extrusion protein  37.13 
 
 		 440 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0123959 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3865  nitrite transporter  44.38 
 
 		 455 aa  147  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1764  hypothetical protein  36.4 
 
 		 434 aa  145  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.959273  hitchhiker  0.00739466 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10271  integral membrane nitrite extrusion protein narU (nitrite facilitator)  43.89 
 
 		 463 aa  145  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0502374 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>