260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1764 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1764  hypothetical protein  100 
 
 
434 aa  850    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.959273  hitchhiker  0.00739466 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0245  major facilitator superfamily MFS_1  55.45 
 
 
453 aa  473  1e-132  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.205061  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0190  nitrate/nitrite transporter-like protein  54.63 
 
 
471 aa  463  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00020327 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5685  major facilitator transporter  57.31 
 
 
455 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.180535  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0175  nitrate/nitrite transporter-like protein  53.74 
 
 
471 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2593  major facilitator transporter  56.62 
 
 
455 aa  451  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.593061  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2044  major facilitator superfamily MFS_1  51.09 
 
 
457 aa  441  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1233  major facilitator superfamily MFS_1  51.86 
 
 
445 aa  414  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.247406 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1704  nitrite transporter  41.38 
 
 
475 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0932912  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1775  nitrite transporter  41.38 
 
 
475 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610965  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2174  nitrate transporter  41.79 
 
 
475 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.642939  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0665  nitrite transporter  38.6 
 
 
460 aa  289  7e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  38.68 
 
 
893 aa  280  3e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0334  nitrate transporter  38.26 
 
 
475 aa  279  7e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000163846 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  38.49 
 
 
905 aa  278  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0604  MFS nitrate/nitrite transporter NarK  36.34 
 
 
459 aa  273  5.000000000000001e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5001  nitrate transporter  37.63 
 
 
461 aa  270  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0909431  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1233  nitrite extrusion protein 2  38.58 
 
 
468 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13770  nitrite extrusion protein 2  38.36 
 
 
468 aa  264  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.45404 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2657  nitrite transporter  37.01 
 
 
457 aa  261  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3863  major facilitator transporter  37.16 
 
 
477 aa  258  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2073  nitrate transporter  38.44 
 
 
460 aa  254  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.741347  normal  0.786812 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0208  nitrite transporter  36.42 
 
 
457 aa  252  7e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2237  nitrite transporter  34.62 
 
 
472 aa  251  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532951  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  34.73 
 
 
912 aa  249  7e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2679  nitrite extrusion protein  37.5 
 
 
490 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2623  nitrite extrusion protein  37.5 
 
 
490 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2755  nitrate/nitrite transporter NarK  37.5 
 
 
461 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1730  nitrate/nitrite transporter NarK  37.28 
 
 
461 aa  246  6e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1855  nitrate/nitrite transporter NarK  36.97 
 
 
461 aa  246  6e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1512  nitrite extrusion protein  37.28 
 
 
461 aa  246  6e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.85958  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3079  nitrite extrusion protein  37.28 
 
 
461 aa  246  6e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2240  nitrite extrusion protein  37.28 
 
 
490 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.452276  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  34.84 
 
 
895 aa  240  4e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0973  nitrite/nitrate ABC transporter transmembrane protein  37.53 
 
 
461 aa  239  5e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3590  nitrite transporter  37.72 
 
 
461 aa  240  5e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.494502  normal  0.38481 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4667  nitrite transporter  37.72 
 
 
461 aa  240  5e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.885517  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6183  cyclic nucleotide-binding protein  37.09 
 
 
469 aa  236  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0259908 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1709  NO3-/NO2- ABC transporter  36.96 
 
 
458 aa  228  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3137  nitrate/nitrite antiporter  29.96 
 
 
530 aa  227  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411824  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  35.46 
 
 
917 aa  225  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0660  nitrite transporter  35.74 
 
 
487 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.556146 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2260  nitrite transporter  33.92 
 
 
462 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2791  nitrate/nitrite antiporter  29.8 
 
 
542 aa  216  8e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.657908  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1108  nitrite transporter  36.72 
 
 
486 aa  215  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2566  nitrite transporter  33.12 
 
 
462 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2301  nitrite transporter  32.96 
 
 
472 aa  212  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.123404 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1916  nitrite extrusion protein 1  35.45 
 
 
463 aa  211  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0184588  normal  0.196505 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2225  nitrite transporter  32.96 
 
 
472 aa  210  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190366  normal  0.0765968 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01201  nitrate/nitrite transporter  35.23 
 
 
463 aa  210  4e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2422  nitrite transporter  35.23 
 
 
463 aa  210  4e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0235943  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1707  nitrite extrusion protein 1  35.23 
 
 
463 aa  210  4e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135678  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01211  hypothetical protein  35.23 
 
 
463 aa  210  4e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853589  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1391  nitrite extrusion protein 1  35.23 
 
 
463 aa  210  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00798499  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2400  nitrite transporter  35.23 
 
 
463 aa  210  4e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000237674 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0435  nitrite transporter  35.33 
 
 
481 aa  210  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1333  nitrite extrusion protein 1  35.23 
 
 
463 aa  210  4e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000558307  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0426  nitrite transporter  35.12 
 
 
481 aa  210  5e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1374  nitrite extrusion protein 1  35.23 
 
 
461 aa  210  5e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0787741  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2898  nitrite transporter  35.65 
 
 
462 aa  207  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1768  nitrite transporter  32.27 
 
 
468 aa  206  5e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1960  nitrite extrusion protein 1  33.91 
 
 
465 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0440291  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1896  nitrite extrusion protein 1  33.91 
 
 
465 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0112468  normal  0.326955 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1901  nitrite extrusion protein 1  33.91 
 
 
465 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0276869  normal  0.947736 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1558  nitrite extrusion protein 1  33.91 
 
 
465 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.431226  normal  0.0433169 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1375  nitrite extrusion protein 1  33.91 
 
 
465 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0207934  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2725  major facilitator superfamily MFS_1  37.44 
 
 
457 aa  203  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.30884  normal  0.0909618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3865  nitrite transporter  34.59 
 
 
455 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2316  nitrite transporter  32.46 
 
 
465 aa  201  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.95434  normal  0.769623 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3598  nitrite transporter  41.18 
 
 
699 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0417643 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4255  nitrite transporter  35.49 
 
 
456 aa  201  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.823889  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1330  major facilitator superfamily MFS_1  34.93 
 
 
469 aa  199  6e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2802  major facilitator superfamily MFS_1  34.54 
 
 
476 aa  197  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197835 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1850  nitrite transporter  32.9 
 
 
463 aa  196  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0349  major facilitator transporter  34.3 
 
 
502 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.11926  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1004  nitrate/nitrite antiporter  29.17 
 
 
551 aa  192  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2362  major facilitator superfamily MFS_1  33.79 
 
 
458 aa  189  7e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.165332  normal  0.523677 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2061  nitrite transporter  32.97 
 
 
463 aa  187  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1553  nitrite extrusion protein 2  32.01 
 
 
462 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.615088  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2187  nitrite transporter  32.01 
 
 
462 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.74785  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01427  nitrate/nitrite transporter  32.01 
 
 
462 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2178  nitrite transporter  32.01 
 
 
462 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01439  hypothetical protein  32.01 
 
 
462 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2079  nitrite extrusion protein 2  32.01 
 
 
462 aa  184  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1705  nitrite extrusion protein 2  32.01 
 
 
462 aa  184  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0635768  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1769  major facilitator superfamily MFS_1  34.3 
 
 
475 aa  182  7e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00234233  hitchhiker  0.00662065 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1650  nitrite extrusion protein 2  31.79 
 
 
462 aa  182  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1693  nitrite extrusion protein 2  32.67 
 
 
466 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.584294 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1313  major facilitator superfamily MFS_1  31.7 
 
 
491 aa  177  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000040275 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1585  nitrite extrusion protein 2  32.67 
 
 
466 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1691  nitrite extrusion protein 2  32.67 
 
 
462 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1766  nitrite extrusion protein 2  32.67 
 
 
466 aa  177  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.408584  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1754  nitrite extrusion protein 2  32.67 
 
 
466 aa  177  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.495939  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6173  major facilitator superfamily MFS_1  34.22 
 
 
438 aa  174  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1268  major facilitator transporter  30.43 
 
 
470 aa  172  9e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0770735  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2417  major facilitator superfamily MFS_1  32.16 
 
 
467 aa  172  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000388918  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0837  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 
450 aa  166  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.738269  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3015  nitrite extrusion protein  31.01 
 
 
484 aa  166  8e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.35043 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1495  major facilitator transporter  33.48 
 
 
464 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.078624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5927  nitrite extrusion protein  32.9 
 
 
440 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0123959 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>