253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0175 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0190  nitrate/nitrite transporter-like protein  94.27 
 
 		 471 aa  865    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00020327 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0175  nitrate/nitrite transporter-like protein  100 
 
 		 471 aa  924    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2044  major facilitator superfamily MFS_1  66.67 
 
 		 457 aa  629  1e-179  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0245  major facilitator superfamily MFS_1  53.19 
 
 		 453 aa  453  1.0000000000000001e-126  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.205061  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1764  hypothetical protein  53.74 
 
 		 434 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.959273  hitchhiker  0.00739466 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2593  major facilitator transporter  51.87 
 
 		 455 aa  429  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.593061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5685  major facilitator transporter  49.69 
 
 		 455 aa  415  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.180535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1233  major facilitator superfamily MFS_1  50.77 
 
 		 445 aa  404  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.247406 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0665  nitrite transporter  36.14 
 
 		 460 aa  277  3e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5001  nitrate transporter  36.98 
 
 		 461 aa  275  9e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0909431  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1775  nitrite transporter  36.7 
 
 		 475 aa  273  6e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610965  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3863  major facilitator transporter  37.35 
 
 		 477 aa  272  9e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2174  nitrate transporter  36.34 
 
 		 475 aa  272  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.642939  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1704  nitrite transporter  36.49 
 
 		 475 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0932912  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  36.69 
 
 		 905 aa  269  8.999999999999999e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0604  MFS nitrate/nitrite transporter NarK  35.74 
 
 		 459 aa  268  1e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2657  nitrite transporter  36.59 
 
 		 457 aa  265  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0334  nitrate transporter  35.73 
 
 		 475 aa  265  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000163846 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2073  nitrate transporter  37.89 
 
 		 460 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.741347  normal  0.786812 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13770  nitrite extrusion protein 2  36.33 
 
 		 468 aa  264  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.45404 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1233  nitrite extrusion protein 2  35.92 
 
 		 468 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0208  nitrite transporter  37.42 
 
 		 457 aa  260  4e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  36.31 
 
 		 893 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2755  nitrate/nitrite transporter NarK  35.95 
 
 		 461 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2237  nitrite transporter  34.46 
 
 		 472 aa  252  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2623  nitrite extrusion protein  35.95 
 
 		 490 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2679  nitrite extrusion protein  35.95 
 
 		 490 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1730  nitrate/nitrite transporter NarK  35.74 
 
 		 461 aa  250  4e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3590  nitrite transporter  37.19 
 
 		 461 aa  250  4e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.494502  normal  0.38481 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1512  nitrite extrusion protein  35.74 
 
 		 461 aa  250  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.85958  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4667  nitrite transporter  37.19 
 
 		 461 aa  250  4e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.885517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3079  nitrite extrusion protein  35.74 
 
 		 461 aa  250  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0973  nitrite/nitrate ABC transporter transmembrane protein  36.98 
 
 		 461 aa  249  5e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2240  nitrite extrusion protein  35.74 
 
 		 490 aa  250  5e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.452276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1855  nitrate/nitrite transporter NarK  35.95 
 
 		 461 aa  249  6e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  36.8 
 
 		 895 aa  246  6e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  35.34 
 
 		 912 aa  246  6.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  36.2 
 
 		 917 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2260  nitrite transporter  34.37 
 
 		 462 aa  242  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6183  cyclic nucleotide-binding protein  35.25 
 
 		 469 aa  240  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0259908 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2566  nitrite transporter  33.95 
 
 		 462 aa  238  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1768  nitrite transporter  34.31 
 
 		 468 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2316  nitrite transporter  33.47 
 
 		 465 aa  223  7e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.95434  normal  0.769623 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01201  nitrate/nitrite transporter  33.6 
 
 		 463 aa  220  5e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2422  nitrite transporter  33.6 
 
 		 463 aa  220  5e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0235943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01211  hypothetical protein  33.6 
 
 		 463 aa  220  5e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853589  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1333  nitrite extrusion protein 1  33.6 
 
 		 463 aa  220  5e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000558307  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1707  nitrite extrusion protein 1  33.6 
 
 		 463 aa  220  5e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1374  nitrite extrusion protein 1  33.6 
 
 		 461 aa  220  5e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0787741  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2400  nitrite transporter  33.6 
 
 		 463 aa  220  5e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237674 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1391  nitrite extrusion protein 1  33.6 
 
 		 463 aa  220  5e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00798499  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0660  nitrite transporter  35.81 
 
 		 487 aa  219  6e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556146 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1916  nitrite extrusion protein 1  33.4 
 
 		 463 aa  219  7e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0184588  normal  0.196505 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1108  nitrite transporter  36.49 
 
 		 486 aa  219  7.999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2301  nitrite transporter  32.36 
 
 		 472 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.123404 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1850  nitrite transporter  32.98 
 
 		 463 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1558  nitrite extrusion protein 1  32.93 
 
 		 465 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.431226  normal  0.0433169 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1896  nitrite extrusion protein 1  32.93 
 
 		 465 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0112468  normal  0.326955 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2225  nitrite transporter  32.15 
 
 		 472 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190366  normal  0.0765968 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1901  nitrite extrusion protein 1  32.93 
 
 		 465 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0276869  normal  0.947736 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1375  nitrite extrusion protein 1  32.93 
 
 		 465 aa  213  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0207934  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0426  nitrite transporter  36.08 
 
 		 481 aa  213  7.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1960  nitrite extrusion protein 1  32.93 
 
 		 465 aa  213  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0440291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0435  nitrite transporter  35.7 
 
 		 481 aa  212  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2898  nitrite transporter  35.48 
 
 		 462 aa  209  7e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01427  nitrate/nitrite transporter  33.82 
 
 		 462 aa  207  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01439  hypothetical protein  33.82 
 
 		 462 aa  207  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2187  nitrite transporter  33.82 
 
 		 462 aa  207  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.74785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1553  nitrite extrusion protein 2  33.82 
 
 		 462 aa  207  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.615088  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2178  nitrite transporter  33.61 
 
 		 462 aa  207  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2079  nitrite extrusion protein 2  33.61 
 
 		 462 aa  206  8e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2061  nitrite transporter  33.13 
 
 		 463 aa  206  8e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1705  nitrite extrusion protein 2  33.4 
 
 		 462 aa  206  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0635768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1650  nitrite extrusion protein 2  33.61 
 
 		 462 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1709  NO3-/NO2- ABC transporter  33.81 
 
 		 458 aa  205  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1693  nitrite extrusion protein 2  33.54 
 
 		 466 aa  203  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.584294 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1585  nitrite extrusion protein 2  33.33 
 
 		 466 aa  203  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1754  nitrite extrusion protein 2  33.33 
 
 		 466 aa  202  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.495939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1766  nitrite extrusion protein 2  33.33 
 
 		 466 aa  202  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.408584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1691  nitrite extrusion protein 2  33.33 
 
 		 462 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3598  nitrite transporter  38.65 
 
 		 699 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0417643 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2802  major facilitator superfamily MFS_1  32.44 
 
 		 476 aa  200  5e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197835 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4255  nitrite transporter  31.97 
 
 		 456 aa  199  7.999999999999999e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.823889  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3865  nitrite transporter  31.13 
 
 		 455 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0349  major facilitator transporter  31.45 
 
 		 502 aa  196  7e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.11926  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1330  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 		 469 aa  190  5.999999999999999e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1769  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 475 aa  187  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00234233  hitchhiker  0.00662065 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2362  major facilitator superfamily MFS_1  31.7 
 
 		 458 aa  182  8.000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.165332  normal  0.523677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1495  major facilitator transporter  33.2 
 
 		 464 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.078624 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3015  nitrite extrusion protein  29.46 
 
 		 484 aa  179  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.35043 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2417  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 		 467 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000388918  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0254  major facilitator transporter  30.04 
 
 		 464 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.78177 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0264  major facilitator transporter  30.04 
 
 		 464 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815534  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0274  major facilitator transporter  30.04 
 
 		 464 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12352  nitrite extrusion protein 1 narK1 (nitrite facilitator 1)  28.48 
 
 		 515 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5927  nitrite extrusion protein  31.48 
 
 		 440 aa  173  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0123959 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6173  major facilitator superfamily MFS_1  30.21 
 
 		 438 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10271  integral membrane nitrite extrusion protein narU (nitrite facilitator)  28.95 
 
 		 463 aa  170  4e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0502374 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2725  major facilitator superfamily MFS_1  32.77 
 
 		 457 aa  171  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.30884  normal  0.0909618 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1313  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 		 491 aa  169  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000040275 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>