25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0470 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0470  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  430  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0120  hypothetical protein  75 
 
 		 284 aa  95.9  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1090  hypothetical protein  53.95 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.224449  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31490  hypothetical protein  38.66 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.265456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8481  hypothetical protein  50 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4388  hypothetical protein  39.09 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3066  hypothetical protein  50 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.704326 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0728  hypothetical protein  50.88 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1007  hypothetical protein  44.44 
 
 		 519 aa  56.2  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.299981  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1364  hypothetical protein  38.89 
 
 		 118 aa  52.4  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.0092194  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1679  hypothetical protein  36.17 
 
 		 229 aa  52  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16840  hypothetical protein  41.07 
 
 		 116 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.505478  normal  0.321464 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1754  hypothetical protein  41.51 
 
 		 117 aa  48.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0779  plectin  37.65 
 
 		 399 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.102651 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3419  hypothetical protein  37.5 
 
 		 120 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.352762  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3150  hypothetical protein  38.18 
 
 		 78 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0235475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4337  hypothetical protein  41.94 
 
 		 184 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159119 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0195  hypothetical protein  38.18 
 
 		 111 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.760426 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4182  hypothetical protein  41.94 
 
 		 184 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4106  hypothetical protein  41.94 
 
 		 184 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2900  hypothetical protein  31.03 
 
 		 170 aa  44.3  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000404833  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22390  hypothetical protein  38.89 
 
 		 114 aa  44.3  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4312  hypothetical protein  33.96 
 
 		 99 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3783  hypothetical protein  36.67 
 
 		 69 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00138484  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  25.68 
 
 		 2449 aa  41.6  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>