17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1679 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1679  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  460  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2078  hypothetical protein  42.98 
 
 
201 aa  142  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0179834  normal  0.111203 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4632  hypothetical protein  41.85 
 
 
193 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.242724  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4106  hypothetical protein  39.19 
 
 
184 aa  131  9e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4182  hypothetical protein  39.19 
 
 
184 aa  131  9e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126083  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11131  hypothetical protein  40.89 
 
 
212 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4337  hypothetical protein  38.74 
 
 
184 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.159119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0728  hypothetical protein  36.49 
 
 
209 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31490  hypothetical protein  38.01 
 
 
186 aa  111  9e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.265456  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3115  hypothetical protein  36.6 
 
 
205 aa  100  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0571387  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4388  hypothetical protein  41.98 
 
 
329 aa  69.3  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0470  hypothetical protein  36.17 
 
 
226 aa  50.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0120  hypothetical protein  45.65 
 
 
284 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1007  hypothetical protein  38.96 
 
 
519 aa  45.4  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.299981  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1090  hypothetical protein  43.48 
 
 
231 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.224449  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8481  hypothetical protein  41.3 
 
 
386 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3066  hypothetical protein  39.13 
 
 
216 aa  41.6  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.704326 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>