22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_31490 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_31490  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  374  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.265456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0728  hypothetical protein  46.3 
 
 		 209 aa  163  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1679  hypothetical protein  38.01 
 
 		 229 aa  111  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2078  hypothetical protein  38.27 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0179834  normal  0.111203 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4632  hypothetical protein  39.68 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.242724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11131  hypothetical protein  35.75 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4106  hypothetical protein  38.25 
 
 		 184 aa  97.1  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4182  hypothetical protein  38.25 
 
 		 184 aa  97.1  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4337  hypothetical protein  37.91 
 
 		 184 aa  95.5  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159119 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3115  hypothetical protein  34.45 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0571387  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4388  hypothetical protein  45.57 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0470  hypothetical protein  37.4 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0120  hypothetical protein  53.85 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1007  hypothetical protein  35.38 
 
 		 519 aa  57  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.299981  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3066  hypothetical protein  50 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.704326 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16840  hypothetical protein  44.44 
 
 		 116 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.505478  normal  0.321464 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1090  hypothetical protein  47.06 
 
 		 231 aa  45.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.224449  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0779  plectin  29.57 
 
 		 399 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.102651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8481  hypothetical protein  40 
 
 		 386 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1364  hypothetical protein  38.71 
 
 		 118 aa  42.4  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.0092194  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0195  hypothetical protein  41.67 
 
 		 111 aa  41.2  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.760426 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0112  hypothetical protein  30.77 
 
 		 119 aa  40.8  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>