15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1364 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1364  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  236  6.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.0092194  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1754  hypothetical protein  58.65 
 
 
117 aa  106  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16840  hypothetical protein  46.67 
 
 
116 aa  93.2  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.505478  normal  0.321464 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0195  hypothetical protein  53.06 
 
 
111 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.760426 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3419  hypothetical protein  42.5 
 
 
120 aa  89  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.352762  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3736  hypothetical protein  44.23 
 
 
111 aa  76.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139071  hitchhiker  0.0052659 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3150  hypothetical protein  53.12 
 
 
78 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0235475  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22390  hypothetical protein  40.2 
 
 
114 aa  70.1  0.000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0792  hypothetical protein  49.18 
 
 
71 aa  61.2  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4312  hypothetical protein  50 
 
 
99 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0470  hypothetical protein  38.89 
 
 
226 aa  51.6  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1090  hypothetical protein  42.31 
 
 
231 aa  45.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.224449  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8481  hypothetical protein  34.55 
 
 
386 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31490  hypothetical protein  38.71 
 
 
186 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.265456  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3066  hypothetical protein  36.73 
 
 
216 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.704326 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>